More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1198 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  100 
 
 
158 aa  318  2e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  58.5 
 
 
157 aa  183  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  55.24 
 
 
171 aa  167  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  51.06 
 
 
165 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  54.23 
 
 
163 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  54.48 
 
 
156 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  53.85 
 
 
166 aa  146  1e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  47.86 
 
 
163 aa  145  2e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  47.92 
 
 
169 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  47.92 
 
 
169 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  49.66 
 
 
170 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  45.45 
 
 
169 aa  128  4e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  44.97 
 
 
166 aa  123  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  41.21 
 
 
194 aa  116  1e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  41.21 
 
 
194 aa  116  1e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  41.21 
 
 
194 aa  116  1e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  38.69 
 
 
160 aa  115  2e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  38.35 
 
 
170 aa  115  2e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  45.26 
 
 
175 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  36.23 
 
 
174 aa  113  8e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  39.16 
 
 
163 aa  113  8e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  40.88 
 
 
165 aa  113  1e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4863e-14 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  41.04 
 
 
162 aa  113  1e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  40.88 
 
 
165 aa  113  1e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  41.84 
 
 
164 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  36.62 
 
 
175 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  36.99 
 
 
174 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  35.57 
 
 
183 aa  111  4e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  37.5 
 
 
178 aa  111  4e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  41.13 
 
 
157 aa  110  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  38.62 
 
 
160 aa  111  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  35.82 
 
 
158 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  41.13 
 
 
164 aa  111  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  35.71 
 
 
168 aa  110  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  37.32 
 
 
156 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  37.59 
 
 
163 aa  110  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  35.37 
 
 
177 aa  110  7e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  35.37 
 
 
177 aa  110  7e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  34.44 
 
 
166 aa  110  7e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  36.81 
 
 
178 aa  110  8e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  37.31 
 
 
174 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  36.3 
 
 
171 aa  110  1e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  36.18 
 
 
171 aa  110  1e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  34.39 
 
 
167 aa  109  1e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  32.7 
 
 
165 aa  108  2e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  36.3 
 
 
171 aa  109  2e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  37.31 
 
 
183 aa  108  2e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  42.45 
 
 
163 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  31.45 
 
 
165 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  39.16 
 
 
161 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  38.52 
 
 
165 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  37.86 
 
 
168 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  37.78 
 
 
165 aa  108  4e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  39.57 
 
 
184 aa  108  4e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  35.56 
 
 
167 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  37.86 
 
 
176 aa  107  7e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  36.11 
 
 
175 aa  107  9e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  37.75 
 
 
159 aa  107  9e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  32.62 
 
 
165 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  35.77 
 
 
165 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46725e-13 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  42.86 
 
 
158 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  32.62 
 
 
165 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  40.3 
 
 
158 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  36.11 
 
 
171 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  36.11 
 
 
174 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  35.77 
 
 
165 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  35.07 
 
 
167 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  35.07 
 
 
167 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 
167 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  9.88763e-05 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 
167 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.73 
 
 
164 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 
167 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 
167 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  5.06085e-10 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 
167 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  41.18 
 
 
158 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 
167 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  35.42 
 
 
163 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  36.57 
 
 
169 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  38.81 
 
 
163 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  41.18 
 
 
158 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  33.8 
 
 
163 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  40.6 
 
 
154 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  33.12 
 
 
167 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.10787e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.73 
 
 
164 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  33.8 
 
 
163 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  33.12 
 
 
167 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.98386e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  33.12 
 
 
167 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  33.12 
 
 
167 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  7.57321e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  33.12 
 
 
167 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.73 
 
 
164 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  41.13 
 
 
178 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  35.42 
 
 
175 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  35.42 
 
 
175 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  35.82 
 
 
171 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  35.42 
 
 
175 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  35.77 
 
 
187 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  35.42 
 
 
175 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  35.42 
 
 
175 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  35.42 
 
 
175 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  38.41 
 
 
185 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>