219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1193 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 
99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  57.75 
 
 
104 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56.34 
 
 
104 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50.62 
 
 
100 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.13 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.45 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.82 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.49 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  48.24 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.9 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.33 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.16 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.68 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  52.11 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.68 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.22 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.5 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.48 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.1 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.31 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.89 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  42.11 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.74 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  43.84 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.94 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.89 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.18 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  47.22 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  45.71 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  45.71 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  45 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.96 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.33 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  45.07 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.4 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.11 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.05 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  39.73 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  40.62 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.58 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  39.58 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  36.08 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  39.58 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  39.58 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  39.58 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.51 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  38.36 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  35.79 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  38.36 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  39.58 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.33 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  39.58 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.78 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  39.58 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  39.58 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.84 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  37.84 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.84 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.44 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.11 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.34 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.21 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.97 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.67 
 
 
120 aa  60.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  38.54 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1395  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.84 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00257587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2462  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.84 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00184271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2558  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.84 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00862222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  36.36 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.77 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  34.94 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  34.74 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2718  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.56 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  36.84 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  36.84 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.63 
 
 
105 aa  58.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  43.42 
 
 
121 aa  58.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  34.09 
 
 
121 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.67 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  33.72 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.67 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  33.72 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.67 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.5 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.67 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>