93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1186 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 580 aa  1148    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  38.04 
 
 		 552 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  26.77 
 
 		 604 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2396  flagellar hook-length control protein  32.73 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  36.49 
 
 		 623 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  33.78 
 
 		 686 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  41.82 
 
 		 523 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2295  flagellar hook-length control protein  33.64 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1651  hypothetical protein  28.12 
 
 		 420 aa  54.7  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 443 aa  54.7  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0855  flagellar hook-length control protein-like protein  25.45 
 
 		 723 aa  53.9  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0776  flagellar hook-length control protein  27.12 
 
 		 536 aa  53.9  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.460138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  27.78 
 
 		 656 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  27.78 
 
 		 660 aa  53.9  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  33.71 
 
 		 579 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  32.63 
 
 		 527 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0602  flagellar hook-length control protein  29.12 
 
 		 528 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  32.63 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1501  flagellar hook-length control protein  23.95 
 
 		 533 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  29.1 
 
 		 542 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  28.97 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  31.91 
 
 		 431 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1021  flagellar hook-length control protein  30.38 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  31.58 
 
 		 585 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  28.3 
 
 		 567 aa  51.6  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  34.83 
 
 		 512 aa  51.2  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2190  flagellar hook-length control protein  33.65 
 
 		 405 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.543478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2137  flagellar hook-length control protein  38.57 
 
 		 407 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2132  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 407 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1145  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 407 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1268  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 405 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2952  flagellar hook-length control protein  31.82 
 
 		 407 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  28.93 
 
 		 430 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  30.53 
 
 		 702 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  30.53 
 
 		 718 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  30.53 
 
 		 537 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  30.53 
 
 		 717 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0694  flagellar hook-length control protein  27.5 
 
 		 525 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  32.65 
 
 		 491 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3106  flagellar hook-length control protein  25.89 
 
 		 479 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2009  flagellar hook-length control protein  27.84 
 
 		 396 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2534  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 407 aa  49.7  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.658569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24180  Flagellar hook-length control protein  31.18 
 
 		 461 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0290673  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  28.38 
 
 		 674 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0471  flagellar hook-length control protein  24.24 
 
 		 528 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2039  flagellar hook-length control protein  28.18 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  35.64 
 
 		 478 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  29.27 
 
 		 479 aa  48.5  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  32.35 
 
 		 593 aa  48.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  33.82 
 
 		 495 aa  47.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2719  flagellar hook-length control protein  32.86 
 
 		 375 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.243255  normal  0.82206 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  31.68 
 
 		 525 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0972  flagellar hook-length control protein  29.05 
 
 		 439 aa  47.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  31.68 
 
 		 525 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0753  flagellar hook-length control protein  30.39 
 
 		 441 aa  47.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4126  flagellar hook-length control protein  26.25 
 
 		 541 aa  47.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1259  flagellar hook-length control protein  28.26 
 
 		 619 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  29.57 
 
 		 487 aa  47  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4206  flagellar hook-length control protein  29.73 
 
 		 612 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0248  flagellar hook-length control protein  31.63 
 
 		 631 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0205536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2341  flagellar hook-length control protein  32.81 
 
 		 678 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.559882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2043  flagellar hook-length control protein  32.86 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.436184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2176  flagellar hook-length control protein  32.86 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000764801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  36.36 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  36.36 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  39.34 
 
 		 364 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  33.82 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1241  flagellar hook-length control protein  32.86 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.896281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0438  flagellar hook-length control protein  27 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00196038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1699  flagellar hook-length control protein  32.86 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0151155 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1705  flagellar hook-length control protein  32.86 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.195068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  42.31 
 
 		 390 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1335  hypothetical protein  27.97 
 
 		 739 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2045  flagellar hook-length control protein  25 
 
 		 510 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  32.35 
 
 		 568 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1397  flagellar hook-length control protein  26.85 
 
 		 637 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.761037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0004  hypothetical protein  27.5 
 
 		 739 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0259  flagellar hook-length control protein  26.6 
 
 		 658 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1634  flagellar hook-length control protein  29.14 
 
 		 531 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0344613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5062  flagellar hook-length control protein  32 
 
 		 526 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0257  flagellar hook-length control protein  26.6 
 
 		 674 aa  45.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  27.17 
 
 		 427 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  32.84 
 
 		 446 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0395  flagellar hook-length control protein  31.58 
 
 		 516 aa  44.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  30.11 
 
 		 428 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  25.93 
 
 		 407 aa  44.3  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2936  flagellar hook-length control protein  34.21 
 
 		 503 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  31.18 
 
 		 609 aa  44.3  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  32.79 
 
 		 389 aa  43.9  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1687  flagellar hook-length control protein  24.58 
 
 		 457 aa  43.9  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3101  flagellar hook-length control protein  29.03 
 
 		 816 aa  43.5  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.964976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>