More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1122 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
364 aa  757    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  37.06 
 
 
307 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
376 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 
295 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 
289 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
363 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  32.11 
 
 
308 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.2 
 
 
466 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
703 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
277 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 
246 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  36.31 
 
 
287 aa  99.4  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  40.68 
 
 
320 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
269 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
280 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  33.51 
 
 
302 aa  97.8  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  32.52 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  38.76 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
280 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
303 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  36.64 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  31.58 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
333 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
319 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 
351 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
347 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
315 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
623 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
322 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
330 aa  89.4  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
327 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
311 aa  89.4  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
365 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
336 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
274 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  37.21 
 
 
255 aa  86.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
370 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
321 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
373 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  38.79 
 
 
334 aa  86.7  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
338 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 
330 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  32.97 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
1035 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
302 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 
276 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1055  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0151578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
1007 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  24.05 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.07 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.21 
 
 
266 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  37.21 
 
 
266 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
249 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.21 
 
 
266 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
983 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
663 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.21 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>