More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1059 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1059  precorrin-4 methylase  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  32.33 
 
 
257 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.36 
 
 
251 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.69 
 
 
260 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.48 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.77 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.63 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.89 
 
 
244 aa  95.5  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.5 
 
 
258 aa  95.5  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1882  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.15 
 
 
259 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.05 
 
 
250 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.47 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.05 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.19 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.62 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.91 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.11 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.33 
 
 
251 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.89 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.38 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2218  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.65 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352147  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.68 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.64 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.43 
 
 
261 aa  92  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  31.62 
 
 
241 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.34 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.58 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2314  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.32 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.84 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.02 
 
 
261 aa  89.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.08 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.71 
 
 
241 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.71 
 
 
241 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.71 
 
 
241 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.71 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.71 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.71 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.91 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.69 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.71 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.2 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.81 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.45 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.54 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.91 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.06 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.4 
 
 
257 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.95 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.69 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.15 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.69 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.69 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.69 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.96 
 
 
252 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.69 
 
 
242 aa  85.1  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.12 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.3 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3515  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.1 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.312418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  32.05 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  29 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  31.62 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.68 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.29 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2179  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.68 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0645183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.41 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.68 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2157  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.06 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.16 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  29.32 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  28.37 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  32.49 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.96 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.08 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.89 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.77 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2540  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.16 
 
 
257 aa  82  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.9 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.94 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.8 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.08 
 
 
867 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.94 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0564  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.5 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.7 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.21 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  30.52 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.96 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.19 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.51 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.34 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.17 
 
 
257 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.28 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.64 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.33 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.56 
 
 
610 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.17 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3123  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.9 
 
 
258 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.64 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.75 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.93 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3211  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.57 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>