216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1058 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  100 
 
 
252 aa  501  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  70.25 
 
 
250 aa  348  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  70.08 
 
 
257 aa  344  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  70.08 
 
 
257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  74.49 
 
 
260 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  66.12 
 
 
367 aa  322  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  72.81 
 
 
227 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  66.95 
 
 
249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  59 
 
 
271 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  53.23 
 
 
271 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  53.23 
 
 
271 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  54.55 
 
 
266 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  56.73 
 
 
268 aa  274  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  60.61 
 
 
240 aa  272  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  54.92 
 
 
270 aa  271  9e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  58.7 
 
 
282 aa  266  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  53.11 
 
 
266 aa  265  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  55.97 
 
 
269 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  54.36 
 
 
269 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  60 
 
 
252 aa  257  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  57.44 
 
 
246 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  58.82 
 
 
264 aa  255  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  50.62 
 
 
270 aa  255  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  56.1 
 
 
274 aa  254  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  51.46 
 
 
269 aa  254  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  53.5 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  53.5 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  52.67 
 
 
279 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  53.09 
 
 
279 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  57.08 
 
 
246 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  53.33 
 
 
282 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  53.09 
 
 
279 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  53.09 
 
 
279 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  53.09 
 
 
279 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  53.09 
 
 
279 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  56.85 
 
 
272 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  53.09 
 
 
279 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  52.67 
 
 
279 aa  248  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  52.67 
 
 
279 aa  248  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  54.18 
 
 
267 aa  248  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  54.13 
 
 
251 aa  246  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  51.87 
 
 
277 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  52.26 
 
 
272 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  52.42 
 
 
252 aa  245  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  56.6 
 
 
252 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  56.05 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  51.43 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  53.47 
 
 
279 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  58.06 
 
 
267 aa  241  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  52.48 
 
 
266 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  50.2 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  52.48 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  53.5 
 
 
251 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  52.26 
 
 
270 aa  239  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  48.05 
 
 
284 aa  235  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  50.21 
 
 
270 aa  233  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  49.39 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  49.39 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  52.85 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  51.05 
 
 
269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  47.97 
 
 
278 aa  231  7.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  50.41 
 
 
242 aa  231  9e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  53.66 
 
 
276 aa  230  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  50.99 
 
 
267 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  49.59 
 
 
275 aa  230  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  51.04 
 
 
267 aa  228  9e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  51.04 
 
 
267 aa  228  9e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  51.64 
 
 
270 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  51.45 
 
 
287 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  49.18 
 
 
288 aa  228  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  53.88 
 
 
270 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  47.33 
 
 
270 aa  225  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  49.18 
 
 
272 aa  224  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  47.28 
 
 
264 aa  224  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  53.44 
 
 
267 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  53.66 
 
 
281 aa  223  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  52.3 
 
 
277 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  45.42 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  51.67 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  52.46 
 
 
269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  51.61 
 
 
268 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  46.72 
 
 
268 aa  219  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  50.82 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  50.61 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  52.67 
 
 
266 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  50.41 
 
 
248 aa  217  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  57.2 
 
 
246 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  47.13 
 
 
271 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  57.72 
 
 
252 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  45.42 
 
 
243 aa  215  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16431  rRNA methyltransferase  44.98 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  49.8 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  48.98 
 
 
271 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  48.74 
 
 
247 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  51.68 
 
 
250 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  44.12 
 
 
248 aa  209  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  52.85 
 
 
268 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  52.1 
 
 
250 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  48.81 
 
 
258 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  49.79 
 
 
268 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>