More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1053 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1053  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  100 
 
 
393 aa  805  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.13017e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3193  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  71.47 
 
 
392 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.78447e-11  hitchhiker  1.55264e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0302  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  71.47 
 
 
392 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.51651e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  71.35 
 
 
392 aa  583  1e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0160  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  71.09 
 
 
392 aa  582  1e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1390  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  69.13 
 
 
394 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0434  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  70.26 
 
 
394 aa  547  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  63.5 
 
 
393 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.93 
 
 
400 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00049074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1014  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.44 
 
 
393 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1277  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.18 
 
 
393 aa  507  1e-142  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05935  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1966  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  65.11 
 
 
393 aa  505  1e-142  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.18 
 
 
393 aa  506  1e-142  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.44 
 
 
393 aa  506  1e-142  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630931  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.67 
 
 
393 aa  506  1e-142  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.67 
 
 
393 aa  504  1e-142  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.93 
 
 
393 aa  507  1e-142  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4162  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.44 
 
 
393 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2767  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.93 
 
 
393 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0850  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.26 
 
 
393 aa  493  1e-138  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.7 
 
 
393 aa  493  1e-138  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.17999 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.15 
 
 
393 aa  491  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000381873  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0558  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.41 
 
 
391 aa  491  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1367  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.44 
 
 
393 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3300  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.38 
 
 
391 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0549  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.46 
 
 
393 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1092  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.38 
 
 
391 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.38 
 
 
391 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1001  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.9 
 
 
391 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0871  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.64 
 
 
391 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000494924  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1122  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.77 
 
 
388 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2756  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.44 
 
 
393 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.966815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1059  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.13 
 
 
391 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3101  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.1 
 
 
391 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1555  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60 
 
 
388 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2242  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.79 
 
 
393 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.1 
 
 
391 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.93 
 
 
393 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.1 
 
 
391 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.862074 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1686  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.61 
 
 
391 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10474  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0829  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.68 
 
 
388 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0973  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.35 
 
 
391 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000246757  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2805  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  62.21 
 
 
392 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.21 
 
 
392 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.49 
 
 
392 aa  472  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2447  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.28 
 
 
393 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.84 
 
 
391 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1634  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.28 
 
 
393 aa  472  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.97 
 
 
388 aa  469  1e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55377  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3070  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.25 
 
 
396 aa  470  1e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.636645  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0081  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.22 
 
 
415 aa  468  1e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.338109 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2351  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.02 
 
 
393 aa  471  1e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975631  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  62.03 
 
 
395 aa  469  1e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.881865  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2124  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.44 
 
 
392 aa  466  1e-130  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2118  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.31 
 
 
392 aa  468  1e-130  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.69 
 
 
396 aa  468  1e-130  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01808  hypothetical protein  57.69 
 
 
392 aa  467  1e-130  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1338  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.69 
 
 
392 aa  467  1e-130  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1941  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.44 
 
 
392 aa  466  1e-130  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02115  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.81 
 
 
391 aa  468  1e-130  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.69 
 
 
392 aa  466  1e-130  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.303586  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2079  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.44 
 
 
392 aa  465  1e-130  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.69 
 
 
392 aa  467  1e-130  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1792  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.69 
 
 
392 aa  468  1e-130  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00174349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3613  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.24 
 
 
378 aa  466  1e-130  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.44 
 
 
392 aa  465  1e-130  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.86 
 
 
392 aa  461  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1834  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.31 
 
 
392 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2418  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.54 
 
 
392 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.64 
 
 
400 aa  460  1e-128  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00220765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.44 
 
 
392 aa  459  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.13864e-07 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.48 
 
 
400 aa  459  1e-128  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2042  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.44 
 
 
392 aa  460  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.489284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2037  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.44 
 
 
392 aa  460  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4943  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.63 
 
 
400 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1241  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.18 
 
 
392 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2097  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.18 
 
 
392 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.310007  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.38 
 
 
399 aa  453  1e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229559  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.15 
 
 
413 aa  454  1e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.37 
 
 
404 aa  453  1e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265969  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1196  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.1 
 
 
404 aa  452  1e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517415  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0097  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.15 
 
 
394 aa  454  1e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0122  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.71 
 
 
405 aa  452  1e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2087  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.36 
 
 
404 aa  452  1e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1245  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.36 
 
 
404 aa  451  1e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.816462 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2342  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.37 
 
 
404 aa  452  1e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0158257 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0318  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.84 
 
 
404 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0201005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2474  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.12 
 
 
401 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530276  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0832  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.84 
 
 
404 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.84 
 
 
404 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60 
 
 
404 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4678  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.54 
 
 
400 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1922  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.84 
 
 
404 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.244182  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.49 
 
 
392 aa  448  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2009  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.04 
 
 
400 aa  448  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1707  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.84 
 
 
404 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1349  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.1 
 
 
464 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5661  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.32 
 
 
404 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541626  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.84 
 
 
404 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3022  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.05 
 
 
391 aa  446  1e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.289298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>