More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1045 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  100 
 
 		 365 aa  721    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  63.11 
 
 		 366 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  62.84 
 
 		 366 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  59.56 
 
 		 366 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  60.93 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  58.47 
 
 		 366 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  58.74 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  57.1 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  51.91 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  51.64 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  52.19 
 
 		 373 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  47.55 
 
 		 369 aa  320  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  49.44 
 
 		 368 aa  315  8e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  48.36 
 
 		 371 aa  309  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  50.68 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  43.13 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  45.65 
 
 		 371 aa  299  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  47.84 
 
 		 373 aa  293  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  43.47 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  47.81 
 
 		 371 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  44.47 
 
 		 368 aa  288  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  47.54 
 
 		 371 aa  288  8e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  46.09 
 
 		 382 aa  286  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  46.67 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  47.04 
 
 		 373 aa  279  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  45.48 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  40.16 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  49.35 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  41.74 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  45.66 
 
 		 368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  45.75 
 
 		 364 aa  269  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  43.06 
 
 		 366 aa  269  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  42.31 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  45.75 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  47.8 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  42.13 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  46.39 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  46.75 
 
 		 373 aa  265  8.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  41.56 
 
 		 387 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  47.5 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  47.19 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  43.41 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  43.41 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  46.65 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  43.29 
 
 		 376 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  46.88 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  46.11 
 
 		 368 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  43.14 
 
 		 368 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  43.13 
 
 		 367 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  42.86 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  40.11 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  40.11 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  43.13 
 
 		 373 aa  255  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  46.2 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  46.2 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  46.2 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  46.2 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  42.08 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  44.34 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  45 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  42.9 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  45.6 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  42.34 
 
 		 370 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  49.45 
 
 		 366 aa  252  8.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  46.79 
 
 		 373 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  41.29 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  40.19 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  45.6 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  40.5 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  44.69 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  48.24 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  44.11 
 
 		 373 aa  249  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  45.34 
 
 		 385 aa  248  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  41.22 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  45.34 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  43.14 
 
 		 376 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  42.01 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  45.02 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  45.45 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  45.45 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  46.56 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  39.73 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  45.45 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  47 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  41.11 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  43.44 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  45.45 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  46.34 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  45.16 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  38.59 
 
 		 363 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  46.13 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  45.45 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  45.45 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  45.45 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  45.45 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  43.44 
 
 		 381 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  45.45 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  45.45 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  45.45 
 
 		 370 aa  239  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>