More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1042 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1042  two component signal transduction response regulator  100 
 
 		 465 aa  954    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  43.67 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1914  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.1 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.943888  hitchhiker  0.00021307 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3097  diguanylate cyclase  44.59 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.948135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  44.37 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1165  diguanylate cyclase  43.64 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000192138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.92 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.44 
 
 		 454 aa  332  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00781234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1474  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.14 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1566  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.94 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1471  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.47 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2393  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.17 
 
 		 455 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3140  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.53 
 
 		 754 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0598  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.48 
 
 		 622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0606  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.48 
 
 		 622 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0571  putative GAF sensor protein  28.98 
 
 		 622 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3743  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.82 
 
 		 722 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.28 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.37 
 
 		 715 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1184  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.85 
 
 		 738 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  30.85 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5255  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.57 
 
 		 707 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.864356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.85 
 
 		 362 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1177  two component signal transduction response regulator  28.33 
 
 		 470 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  41.05 
 
 		 681 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0614  putative GAF sensor protein  27.42 
 
 		 622 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00376401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.37 
 
 		 841 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.2 
 
 		 704 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.4 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0703  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.76 
 
 		 703 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 580 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  28.99 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.02 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  28.21 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  37.96 
 
 		 764 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  37.79 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.2 
 
 		 713 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  29.75 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5014  response regulator/sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  31.56 
 
 		 719 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  39.72 
 
 		 836 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  29.27 
 
 		 461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  31.89 
 
 		 719 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.9 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  37.79 
 
 		 764 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  29.07 
 
 		 356 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  37.79 
 
 		 764 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  39.25 
 
 		 792 aa  136  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3350  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  42.94 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.09 
 
 		 706 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 		 1073 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  26.82 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.38 
 
 		 353 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0634  response regulator  28.17 
 
 		 470 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00145352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.63 
 
 		 710 aa  132  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.33 
 
 		 738 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4832  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.8 
 
 		 708 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  39.89 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  30.38 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4959  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.3 
 
 		 708 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0691  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.66 
 
 		 742 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0842  GGDEF domain-containing protein  31.95 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000293697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  38.12 
 
 		 357 aa  130  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.87 
 
 		 703 aa  130  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  34.96 
 
 		 732 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  27.33 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.18 
 
 		 435 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  25.77 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  39.88 
 
 		 517 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  37.6 
 
 		 369 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 758 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 1644 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  29.65 
 
 		 454 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1759  diguanylate cyclase  35.68 
 
 		 266 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0198551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0744  diguanylate cyclase  37.57 
 
 		 753 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165088  normal  0.416995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27 
 
 		 457 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  32 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  32.5 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0500  diguanylate cyclase  30.97 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.37 
 
 		 465 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 335 aa  124  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2778  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.5 
 
 		 1010 aa  123  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 609 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  43.56 
 
 		 688 aa  123  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.23 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  43.31 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  34.09 
 
 		 353 aa  123  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  34.17 
 
 		 709 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  37.63 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.85 
 
 		 586 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2715  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.64 
 
 		 314 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.77 
 
 		 848 aa  121  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.79 
 
 		 550 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.26 
 
 		 322 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  39.31 
 
 		 505 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.22 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0050  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.6 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.03 
 
 		 563 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  37.76 
 
 		 680 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>