More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1001 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  78.17 
 
 		 451 aa  723    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  76.39 
 
 		 454 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 460 aa  934    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  77.28 
 
 		 451 aa  723    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  76.61 
 
 		 452 aa  711    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  76.84 
 
 		 454 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  76.39 
 
 		 454 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  77.06 
 
 		 453 aa  726    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  63.96 
 
 		 469 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  60.57 
 
 		 458 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  59.91 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  59.91 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  57.56 
 
 		 450 aa  547  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  58.61 
 
 		 454 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  57.33 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  57.33 
 
 		 450 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  57.11 
 
 		 450 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  56 
 
 		 450 aa  527  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  57.27 
 
 		 449 aa  521  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  56.22 
 
 		 483 aa  512  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  55.48 
 
 		 447 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  56.85 
 
 		 445 aa  494  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  55.26 
 
 		 449 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  56.98 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  55.43 
 
 		 447 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  54.65 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  54.98 
 
 		 447 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0202  phosphoglucosamine mutase  52.8 
 
 		 459 aa  481  1e-135  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  54.38 
 
 		 452 aa  482  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  54.99 
 
 		 447 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  52.24 
 
 		 450 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  52.47 
 
 		 450 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  53.67 
 
 		 452 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  54.4 
 
 		 451 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  54.59 
 
 		 456 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  54.05 
 
 		 444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  52.78 
 
 		 448 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  52.67 
 
 		 445 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  52.78 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  54.98 
 
 		 452 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  54.19 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  54.19 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  52.68 
 
 		 465 aa  461  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  52.9 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  52.89 
 
 		 448 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  51.67 
 
 		 447 aa  458  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  53.38 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  51.77 
 
 		 450 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  54.17 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  51.44 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  53.02 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  52.24 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  52.56 
 
 		 448 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  51.34 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  52.34 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  52.34 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  52.34 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  52.34 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  53.46 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  52.34 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  52.56 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  52.02 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  53.35 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  52.12 
 
 		 448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  52.34 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  52.34 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  52.12 
 
 		 448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  51.33 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  51.43 
 
 		 445 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  51.66 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  52.86 
 
 		 447 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  51.79 
 
 		 449 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 		 449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  51.56 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  51.11 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 450 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  53.45 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  51.57 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  52.08 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  54.61 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  49.01 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  50.78 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  49.78 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 		 450 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  52.31 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  52.31 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 		 453 aa  435  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  50.78 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  49 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  49.11 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  50.55 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  48.34 
 
 		 452 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>