97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0994 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  236  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  56 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  57.61 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  55.21 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.12 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.12 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  52.43 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  51 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  53.85 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  49.02 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  49.54 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  50.54 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  51 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.38 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.83 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.38 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.75 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.98 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  44 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  49.52 
 
 		 109 aa  100  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  40.87 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.11 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.54 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.3 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  42 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  48.42 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  45.37 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  42.99 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.37 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  41 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.17 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  39.8 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.61 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.33 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  48.75 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  41.49 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.61 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  34.69 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  34.34 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.56 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  38.82 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  35.96 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  44.44 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  31.71 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.84 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  32.38 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  30.59 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  34.92 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  36.62 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  39.44 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  33.78 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 277 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  36.49 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  36.49 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  36.49 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  31.31 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.21 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  32.35 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  38.96 
 
 		 312 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  37.97 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  34.88 
 
 		 122 aa  43.5  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  28.74 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  27.17 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  35.94 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  26.19 
 
 		 118 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 113 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  33.82 
 
 		 109 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  35.44 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  28.74 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1252  hypothetical protein  23.86 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00699027  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  28.75 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.66 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  27.94 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.07 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  29.29 
 
 		 182 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  30.14 
 
 		 112 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  33.73 
 
 		 155 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>