49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0961 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0961  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2475  CRISPR-associated protein, Cse3 family  50.67 
 
 		 292 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2988  CRISPR-associated Cse3 family protein  41.46 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.9 
 
 		 224 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.43 
 
 		 222 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.79 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  28 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.78 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3149  crispr-associated protein Cse3 family  29 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.95 
 
 		 228 aa  109  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  27.95 
 
 		 216 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  27.95 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.09 
 
 		 224 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.04 
 
 		 225 aa  96.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3093  crispr-associated protein, Cse3 family  27 
 
 		 235 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.27 
 
 		 216 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  40.15 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3586  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.74 
 
 		 215 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  36.09 
 
 		 216 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  36.09 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  35.34 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.33 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  33.82 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  32.59 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0423  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.88 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0256253  normal  0.0209563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  31.39 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.16 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0617652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.61 
 
 		 241 aa  52.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  36.26 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  45.65 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0022  hypothetical protein  27.93 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  33.33 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  35.71 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.83 
 
 		 207 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  32.95 
 
 		 238 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.5 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  41.86 
 
 		 199 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  33.33 
 
 		 240 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  29.2 
 
 		 230 aa  45.8  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  36.78 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1588  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.42 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  41.67 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  46.34 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0829  CRISPR-associated Cse3 family protein  22.11 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  40.48 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  38.1 
 
 		 199 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3905  CRISPR-associated protein, Cse3 family  43.24 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  0.123474 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0984  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.57 
 
 		 226 aa  42.7  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  39.58 
 
 		 215 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>