297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0923 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  100 
 
 
232 aa  472  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  49.55 
 
 
235 aa  228  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  49.55 
 
 
235 aa  228  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  48.62 
 
 
225 aa  204  9e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  45.61 
 
 
237 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2970  6-phosphogluconolactonase  45.45 
 
 
235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.504923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  47.93 
 
 
232 aa  167  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2833  6-phosphogluconolactonase  47.71 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2455  6-phosphogluconolactonase  47.71 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.233722  normal  0.737843 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  45.59 
 
 
228 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2481  6-phosphogluconolactonase  49.72 
 
 
218 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.14233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2299  6-phosphogluconolactonase  47.28 
 
 
221 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.020573  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  41.99 
 
 
262 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  42.22 
 
 
242 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  41.03 
 
 
241 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  35.5 
 
 
238 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  35.53 
 
 
239 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  34.13 
 
 
245 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  40.89 
 
 
241 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  41.84 
 
 
252 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  33.77 
 
 
236 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  33.77 
 
 
236 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  37.63 
 
 
241 aa  122  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  30.98 
 
 
373 aa  121  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  33.93 
 
 
235 aa  118  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  38.84 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  39.32 
 
 
429 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  37.17 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  34.53 
 
 
241 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  35.17 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  33.76 
 
 
240 aa  114  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  34.93 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  39.8 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  38.73 
 
 
261 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  37.62 
 
 
256 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  39.81 
 
 
239 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  40.67 
 
 
243 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  37.95 
 
 
248 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  37.2 
 
 
257 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  34.2 
 
 
245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  34.13 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  34.38 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  40.38 
 
 
243 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  33.66 
 
 
245 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  30.18 
 
 
294 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  33.66 
 
 
245 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  33.66 
 
 
245 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  36.14 
 
 
242 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  31.25 
 
 
279 aa  105  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  34.63 
 
 
245 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  29.07 
 
 
244 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  35.15 
 
 
243 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3321  6-phosphogluconolactonase  37.85 
 
 
256 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  35.45 
 
 
243 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  30.61 
 
 
264 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  37.84 
 
 
240 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  30.86 
 
 
303 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  37.7 
 
 
447 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  29.02 
 
 
272 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  32.46 
 
 
240 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  39.33 
 
 
225 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  35.64 
 
 
243 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  31.33 
 
 
265 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  29.26 
 
 
238 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  40.11 
 
 
243 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  33.49 
 
 
238 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 
246 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  35.27 
 
 
248 aa  101  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  33.94 
 
 
271 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  29.86 
 
 
241 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  31.47 
 
 
232 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  31.07 
 
 
248 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4866  6-phosphogluconolactonase  34.55 
 
 
234 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.102715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  32.31 
 
 
260 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3789  6-phosphogluconolactonase  34.55 
 
 
234 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  29.13 
 
 
239 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  28.44 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  33 
 
 
241 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.07 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  32.5 
 
 
247 aa  99  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  29.79 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  34.42 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  29.6 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.88 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  33.5 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  32.18 
 
 
245 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  35.37 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  29.41 
 
 
245 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2926  6-phosphogluconolactonase  33.51 
 
 
249 aa  95.9  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  28.75 
 
 
277 aa  96.3  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  34.42 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31882  predicted protein  30.37 
 
 
276 aa  95.5  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  34.86 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  31.08 
 
 
272 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1157  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  35.42 
 
 
265 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>