297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0892 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0892  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.86741e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  44.44 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  41.86 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  41.11 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  44.05 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  40.7 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  45.12 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  40.7 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  45.68 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  41.67 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  40.91 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  44.87 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  41.86 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  41.86 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  41.77 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  41.86 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  40.66 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  40.91 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  40.91 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  40.7 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  44.87 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  44.87 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  42.05 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3728  protein of unknown function DUF156  44.3 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00718584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  39.77 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  39.77 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  46.34 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  46.34 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  43.59 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  46.34 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  43.59 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  47.69 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  39.77 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  39.77 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  44.29 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  42.31 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  45.12 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  37.36 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  36.96 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  36.96 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  38.82 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  43.24 
 
 
103 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  32.95 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  40.24 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2921  hypothetical protein  42.17 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  43.08 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  39.02 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  42.17 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2141  hypothetical protein  44.3 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.52001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  41.89 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  44.58 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  36.05 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  36.05 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  38.89 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0914  hypothetical protein  46.88 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2851  hypothetical protein  46.88 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  36.67 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  35.42 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  44.62 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1210  protein of unknown function DUF156  44.29 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1211  hypothetical protein  42.86 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364409  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01250  hypothetical protein  38.54 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1694  hypothetical protein  40.7 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.607073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  41.1 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  37.35 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  42.86 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3676  protein of unknown function DUF156  37.8 
 
 
103 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0410766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  44.44 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  36.14 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  44.44 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  37.84 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  38.75 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  39.51 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2639  protein of unknown function DUF156  40.26 
 
 
86 aa  60.1  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.975232  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  35.63 
 
 
129 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  37.35 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  35.23 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  34.52 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  34.41 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  39.19 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  36.36 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  32.22 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  35.06 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  35.56 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  42.86 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3147  hypothetical protein  34.52 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>