52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0821 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  54.17 
 
 
73 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  50 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  51.39 
 
 
71 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  50 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  42.65 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  39.73 
 
 
193 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  43.48 
 
 
73 aa  63.5  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  45.21 
 
 
74 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  41.43 
 
 
195 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  41.67 
 
 
196 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.79 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  44.93 
 
 
198 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  37.31 
 
 
196 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  38.03 
 
 
71 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  49.02 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  38.89 
 
 
195 aa  53.5  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  40.3 
 
 
193 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  49.02 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  50.98 
 
 
202 aa  50.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  42.31 
 
 
200 aa  50.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  39.13 
 
 
196 aa  50.1  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  38.57 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  33.82 
 
 
199 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  35.38 
 
 
200 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  40.98 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  40.3 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  41.79 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  41.67 
 
 
223 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  33.82 
 
 
204 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  34.85 
 
 
195 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  34.62 
 
 
80 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  34.62 
 
 
80 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  34.85 
 
 
195 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  37.68 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  39.62 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  37.68 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  36.23 
 
 
190 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  37.5 
 
 
209 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  32.05 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  35.29 
 
 
211 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  34.78 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  31.75 
 
 
208 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  36.73 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  37.14 
 
 
199 aa  41.6  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  34.29 
 
 
204 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  34.52 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  28.57 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>