More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0766 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  100 
 
 		 121 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.94 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  47.17 
 
 		 243 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 229 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  42.86 
 
 		 356 aa  92  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 229 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 231 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 278 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.52 
 
 		 322 aa  91.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 523 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  44.86 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  45.28 
 
 		 243 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.45 
 
 		 247 aa  90.5  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 231 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  39.32 
 
 		 705 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 246 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 231 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 1651 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 239 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  38.6 
 
 		 355 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 373 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 221 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 237 aa  89  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  88.2  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  44.23 
 
 		 457 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 		 474 aa  88.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  88.2  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4210  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00926762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  36.67 
 
 		 246 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 230 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2980  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 138 aa  87.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 230 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 253 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 230 aa  87  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 253 aa  87  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 254 aa  87.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 230 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 367 aa  87  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 223 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 392 aa  86.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  42.73 
 
 		 247 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 230 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 240 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 230 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 230 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.94 
 
 		 488 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0289  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.65 
 
 		 443 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  37.61 
 
 		 1384 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.65 
 
 		 443 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  40 
 
 		 129 aa  85.9  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 251 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  37.61 
 
 		 248 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  38.05 
 
 		 312 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  40.17 
 
 		 705 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 242 aa  85.5  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.32 
 
 		 434 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.32 
 
 		 434 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 248 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.25 
 
 		 229 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.34 
 
 		 231 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  43.27 
 
 		 457 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.18 
 
 		 589 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 233 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4555  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  35 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  36.44 
 
 		 248 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  43.27 
 
 		 1404 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  84.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 236 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.95 
 
 		 454 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  35.59 
 
 		 248 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  37.61 
 
 		 269 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  41.35 
 
 		 457 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.91 
 
 		 457 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.88 
 
 		 371 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 227 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 235 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2032  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.37 
 
 		 310 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 243 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1873  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0747  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 121 aa  84.3  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>