More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0742 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 
554 aa  729    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
554 aa  1137    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  61.98 
 
 
554 aa  726    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
556 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
559 aa  618  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 
559 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
586 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
556 aa  548  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
556 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
556 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
556 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
592 aa  548  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
556 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
561 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
561 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
556 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
556 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
568 aa  545  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
556 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
556 aa  548  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
570 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
563 aa  548  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
556 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
557 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
556 aa  542  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
556 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
551 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
562 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
589 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
551 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
559 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
584 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
586 aa  527  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
553 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
589 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
553 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  49.72 
 
 
563 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
561 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
569 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
564 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  50.66 
 
 
551 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
553 aa  521  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
564 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
551 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 
598 aa  518  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
551 aa  518  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
588 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
579 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
550 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
579 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
587 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
592 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
586 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
564 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
560 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
585 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
611 aa  506  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
561 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
575 aa  503  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
587 aa  501  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
564 aa  498  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
609 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
546 aa  485  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
561 aa  482  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
587 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
546 aa  484  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
609 aa  476  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
605 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
556 aa  472  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
609 aa  474  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
556 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
556 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
550 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
553 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
562 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
598 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
561 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
575 aa  456  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
542 aa  453  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
594 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
594 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
594 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
594 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
597 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
594 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
597 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
594 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
594 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
592 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
590 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
562 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
594 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
597 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2351  arginyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
585 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>