219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0739 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  100 
 
 		 701 aa  1446    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  36.08 
 
 		 710 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  37.97 
 
 		 628 aa  428  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  36.42 
 
 		 697 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  34.3 
 
 		 684 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  34.39 
 
 		 684 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  31.06 
 
 		 705 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 		 686 aa  278  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  25.43 
 
 		 799 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  26.25 
 
 		 756 aa  251  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  27.63 
 
 		 784 aa  221  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 		 765 aa  209  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  25.38 
 
 		 777 aa  207  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  25.23 
 
 		 781 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  23.67 
 
 		 778 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  23.92 
 
 		 728 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  23.9 
 
 		 757 aa  151  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  26.4 
 
 		 753 aa  150  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  26.89 
 
 		 727 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  26.89 
 
 		 701 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 		 813 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  25 
 
 		 813 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  25.73 
 
 		 929 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  24.29 
 
 		 794 aa  137  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  25.07 
 
 		 811 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  22.84 
 
 		 937 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 		 792 aa  135  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  26.07 
 
 		 738 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  24.02 
 
 		 926 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  27.71 
 
 		 792 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  22.35 
 
 		 764 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  27.55 
 
 		 762 aa  132  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  26.47 
 
 		 836 aa  130  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  24.14 
 
 		 905 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  26.07 
 
 		 813 aa  128  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  24.34 
 
 		 938 aa  124  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  24.65 
 
 		 821 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  21.53 
 
 		 765 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  22.49 
 
 		 765 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  22.49 
 
 		 765 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  26.06 
 
 		 765 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  21.87 
 
 		 766 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  22.57 
 
 		 765 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  22.85 
 
 		 922 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  20.61 
 
 		 774 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  21.95 
 
 		 773 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  25.47 
 
 		 765 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  25.16 
 
 		 765 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  22.51 
 
 		 935 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  24.84 
 
 		 765 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  22.47 
 
 		 932 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  24.84 
 
 		 765 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  28.92 
 
 		 919 aa  114  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  30.93 
 
 		 832 aa  114  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  27.19 
 
 		 934 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  21.48 
 
 		 784 aa  111  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  23.49 
 
 		 1091 aa  109  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  22.87 
 
 		 810 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  23.84 
 
 		 766 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  23.36 
 
 		 735 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  22.82 
 
 		 776 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  24.86 
 
 		 826 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  21.82 
 
 		 786 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  21.82 
 
 		 786 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  21.94 
 
 		 786 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  23.67 
 
 		 799 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  23.17 
 
 		 751 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  21.78 
 
 		 786 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  21.78 
 
 		 786 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  21.78 
 
 		 786 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  20.58 
 
 		 773 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  21.27 
 
 		 786 aa  104  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  21.8 
 
 		 771 aa  104  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  21.65 
 
 		 781 aa  104  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  21.38 
 
 		 774 aa  104  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  21.82 
 
 		 750 aa  104  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  21.43 
 
 		 790 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  20.4 
 
 		 839 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  24.57 
 
 		 819 aa  103  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  20.34 
 
 		 839 aa  101  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  22.39 
 
 		 849 aa  101  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  29.62 
 
 		 863 aa  101  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  26.88 
 
 		 924 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  22.01 
 
 		 781 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  28.96 
 
 		 743 aa  99.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  22.89 
 
 		 808 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  25.53 
 
 		 856 aa  99.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  24.29 
 
 		 787 aa  98.6  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  26.35 
 
 		 814 aa  98.2  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  24.44 
 
 		 781 aa  95.9  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  20.61 
 
 		 778 aa  95.5  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  22.31 
 
 		 787 aa  95.9  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  24.32 
 
 		 860 aa  95.5  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  26.79 
 
 		 824 aa  95.5  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  23.11 
 
 		 671 aa  95.1  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  26.3 
 
 		 794 aa  95.1  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 		 774 aa  94.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2696  OstA family protein  31.62 
 
 		 816 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.996193  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  24.8 
 
 		 912 aa  94.4  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  24.8 
 
 		 997 aa  94.7  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>