More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0720 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  100 
 
 		 147 aa  290  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  69.39 
 
 		 146 aa  201  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  69.39 
 
 		 146 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  65.99 
 
 		 146 aa  196  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  68.03 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  64.63 
 
 		 147 aa  193  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  68.71 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  65.99 
 
 		 146 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  68.03 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  66.21 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 146 aa  176  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  62.59 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  61.22 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  62.59 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 146 aa  173  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  62.59 
 
 		 146 aa  173  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  62.59 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  60.54 
 
 		 146 aa  169  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  56.46 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  61.22 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  59.46 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  60.81 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  60.81 
 
 		 148 aa  163  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  60.14 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  57.82 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  60.14 
 
 		 147 aa  153  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 176 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  58.78 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  59.18 
 
 		 172 aa  148  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  55.1 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  54.42 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  58.33 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  56.25 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  58.4 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 153 aa  139  9e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  52.32 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  49.66 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  52.29 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 		 144 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  133  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  52.11 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5768  ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.903415 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0477  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2404  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 185 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.014337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>