269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0719 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  63.79 
 
 		 61 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 59 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 57 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1084  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055199  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  49.18 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0355  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1836  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.279591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 61 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  58.18 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0476  50S ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  45.61 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2306  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  51.79 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  51.79 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0412  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0387  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  46.94 
 
 		 51 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2516  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  42.11 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4225  ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00829354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>