More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0716 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  350  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  64.25 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  62.57 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  63.13 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  59.22 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  57.87 
 
 		 178 aa  207  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  56.91 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  56.18 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  193  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 181 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  56 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  54.7 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  56.35 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  56.98 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  184  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  184  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  55.31 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  54.14 
 
 		 178 aa  181  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  52.25 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  56.73 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  54.14 
 
 		 178 aa  181  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2357  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.700236  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  52.57 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  52.78 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  180  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 182 aa  180  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  54.14 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 175 aa  179  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  51.69 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>