More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0712 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  61.11 
 
 		 108 aa  140  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  61.54 
 
 		 106 aa  133  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  53.27 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  58.65 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  59.43 
 
 		 107 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  61.17 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 105 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 105 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  53.7 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  57.8 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  57.8 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 104 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  58.72 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  59.26 
 
 		 108 aa  121  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  59.63 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  55.96 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  54.63 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 103 aa  120  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 103 aa  120  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 106 aa  120  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  56.88 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  56.6 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 106 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  55.05 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  48.6 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  54.72 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  54.21 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 105 aa  113  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  52.73 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  45.28 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  48.15 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  51.85 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0878  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0510214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 		 110 aa  103  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  50.93 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  48.15 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0416  50S ribosomal protein L24P  52.94 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.227235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4306  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000126624  unclonable  0.0000000000482395 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2361  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.449778  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0637  ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000374833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4159  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000135344  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4045  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000115284  unclonable  0.00000000000347385 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0211  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000151512  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0207  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4537  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407127  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5068  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4679  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000175822  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3748  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000844667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4925  ribosomal protein L24  56.67 
 
 		 93 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0021231  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  51.96 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0730  ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00351151  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0159  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000158735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0432  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0323669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>