More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0711 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  244  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 		 122 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 		 122 aa  207  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 		 122 aa  207  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 		 122 aa  206  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 		 122 aa  206  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 		 122 aa  205  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  76.23 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  191  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  76.47 
 
 		 119 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  75.41 
 
 		 122 aa  189  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  75.63 
 
 		 119 aa  187  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  75.63 
 
 		 119 aa  187  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  186  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  185  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  71.31 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  72.36 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2847  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.169441  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1151  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000029859  hitchhiker  0.000136956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2808  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1624  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118658  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  69.67 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0333  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3514  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000000971398  hitchhiker  0.0000000993182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000686211  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23370  LSU ribosomal protein L14P  74.59 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000150198  hitchhiker  0.00000101977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2159  ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  176  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  0.234702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0209  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  176  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000783704  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2976  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  175  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0223  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000101155  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0403  ribosomal protein L14  69.11 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0241  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000379152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172755  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  69.11 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000402045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4046  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000176442  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3626  50S ribosomal protein L14  69.11 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000411381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0206  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1023  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000448191  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3734  50S ribosomal protein L14  69.11 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000182354  normal  0.0166061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3626  50S ribosomal protein L14  69.11 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00182904  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  69.11 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000364384  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000305715  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3797  50S ribosomal protein L14  69.11 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>