More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0692 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  341  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  56.65 
 
 		 174 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  57.23 
 
 		 174 aa  197  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  55.49 
 
 		 174 aa  191  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  53.8 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  56.4 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  56.4 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  51.45 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  50.29 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  49.7 
 
 		 174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  51.5 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  45.88 
 
 		 175 aa  157  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  45.29 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  43.6 
 
 		 172 aa  148  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 166 aa  148  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  43.98 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  45.83 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  41.57 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  47.71 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  47.71 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  44.08 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  41.76 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  44.64 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  41.52 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  44.74 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  41.29 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  43.42 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  41.86 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  39.41 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  41.07 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  41.07 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  41.21 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 173 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  42.42 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  42.42 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  41.06 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  46.05 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  46.05 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  41.45 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  42 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  42.76 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.18 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  45.39 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 176 aa  117  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  43.62 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  34.67 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  43.54 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  42.66 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 175 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  37.8 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  40.69 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  35.67 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  41.29 
 
 		 165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>