More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0662 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  100 
 
 
270 aa  541  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  51.34 
 
 
269 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  51.55 
 
 
268 aa  249  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  48.51 
 
 
269 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 
270 aa  234  8e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  48.51 
 
 
269 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  45.63 
 
 
269 aa  227  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  47.01 
 
 
281 aa  227  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  47.55 
 
 
269 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  48.66 
 
 
263 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  48.66 
 
 
263 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  46.74 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  41.64 
 
 
270 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  43.61 
 
 
268 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  42.8 
 
 
290 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  41.13 
 
 
276 aa  188  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  41.37 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  43.73 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  43.35 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  39.33 
 
 
270 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  39.33 
 
 
270 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  39.85 
 
 
278 aa  175  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  41.06 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  38.55 
 
 
270 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  39.1 
 
 
269 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  40.61 
 
 
278 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  40.61 
 
 
278 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  40.61 
 
 
281 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  40.61 
 
 
281 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  39.41 
 
 
276 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  41.54 
 
 
282 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  41.73 
 
 
267 aa  168  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  35.74 
 
 
270 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  41.22 
 
 
279 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  34.47 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  40.46 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  36.19 
 
 
262 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  36.19 
 
 
262 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  38.61 
 
 
257 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  41.92 
 
 
282 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  41.92 
 
 
282 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  41.92 
 
 
282 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  41.92 
 
 
282 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  38.37 
 
 
261 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  41.92 
 
 
282 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  41.92 
 
 
282 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  35.41 
 
 
265 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  41.47 
 
 
262 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  35.34 
 
 
263 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  35.56 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  33.46 
 
 
263 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  38.52 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.43 
 
 
260 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  35.1 
 
 
263 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  37.6 
 
 
274 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  149  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  34.1 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  36.15 
 
 
265 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  36.15 
 
 
265 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  33.74 
 
 
263 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  32.93 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  35.97 
 
 
263 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  32.94 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  32.94 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  32.69 
 
 
258 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  31.68 
 
 
264 aa  122  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  36.93 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  39.81 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  48.2 
 
 
141 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  36.21 
 
 
252 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  36.1 
 
 
252 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  30.66 
 
 
266 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  46.76 
 
 
142 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  42.45 
 
 
141 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  29.77 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.73 
 
 
262 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  38.86 
 
 
254 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  43.88 
 
 
142 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  47.14 
 
 
143 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  29.77 
 
 
259 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  29.96 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  28.05 
 
 
263 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  29.01 
 
 
259 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  37 
 
 
254 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  38.39 
 
 
254 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  38.68 
 
 
254 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  30.89 
 
 
263 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  28.84 
 
 
259 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0139669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3862  molybdenum transport regulatory protein ModE  27.86 
 
 
259 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  34.44 
 
 
254 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  43.17 
 
 
142 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  27.86 
 
 
259 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3194  ModE family transcriptional regulator  29.01 
 
 
259 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.112161  hitchhiker  0.0000253797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  39.57 
 
 
142 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 
262 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0864  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 
262 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108345  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0788  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 
262 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2901  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 
262 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.052498  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0682  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 
262 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 
262 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>