More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0607 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  100 
 
 
208 aa  414  1e-115  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  57.69 
 
 
213 aa  222  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.22 
 
 
220 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.74 
 
 
218 aa  201  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59 
 
 
206 aa  201  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.24 
 
 
218 aa  199  2e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.51 
 
 
213 aa  195  5e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.9 
 
 
223 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  43.35 
 
 
209 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.35 
 
 
223 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49 
 
 
252 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.79 
 
 
207 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1337  Thiamine-phosphate diphosphorylase  50.25 
 
 
203 aa  152  3e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  49.24 
 
 
203 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.28 
 
 
215 aa  151  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.46383e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.5 
 
 
346 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.59 
 
 
214 aa  147  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.69 
 
 
206 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.3 
 
 
219 aa  147  1e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.42 
 
 
210 aa  146  2e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.28 
 
 
236 aa  146  2e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41 
 
 
207 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.51 
 
 
211 aa  145  4e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.16 
 
 
228 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.98 
 
 
224 aa  142  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
379 aa  141  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.95 
 
 
221 aa  140  1e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.56 
 
 
211 aa  139  2e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.39 
 
 
206 aa  139  2e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  38.31 
 
 
204 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.5 
 
 
368 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.39 
 
 
211 aa  138  5e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.31 
 
 
202 aa  138  5e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.12 
 
 
204 aa  138  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.38 
 
 
206 aa  137  8e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.5 
 
 
350 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  42.42 
 
 
212 aa  136  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.05 
 
 
205 aa  136  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.55 
 
 
350 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.39 
 
 
347 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
211 aa  135  3e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.88 
 
 
206 aa  136  3e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.33 
 
 
178 aa  135  3e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1435  Thiamine-phosphate diphosphorylase  50.25 
 
 
203 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00770563  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 
223 aa  135  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.85 
 
 
208 aa  135  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.89 
 
 
208 aa  135  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.05 
 
 
360 aa  134  7e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  39.46 
 
 
217 aa  134  7e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  36.59 
 
 
210 aa  134  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  9.01813e-06 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38 
 
 
343 aa  134  1e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
365 aa  134  1e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.66 
 
 
217 aa  134  1e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.73 
 
 
219 aa  133  2e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.87 
 
 
214 aa  133  2e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38 
 
 
343 aa  133  2e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.91 
 
 
209 aa  133  2e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.7 
 
 
353 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.98 
 
 
210 aa  132  4e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  7.28866e-05 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.41 
 
 
344 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.86 
 
 
352 aa  129  2e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
343 aa  130  2e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.06 
 
 
211 aa  129  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
219 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.97058e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.18 
 
 
212 aa  129  4e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.26 
 
 
356 aa  128  5e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.5 
 
 
206 aa  128  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  37.3 
 
 
183 aa  128  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.80325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.46 
 
 
212 aa  128  7e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.73 
 
 
221 aa  128  7e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.29 
 
 
216 aa  127  9e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 
217 aa  127  2e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32 
 
 
353 aa  127  2e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.96 
 
 
343 aa  126  2e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1224  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.14 
 
 
210 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.71764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.65 
 
 
206 aa  125  4e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.42 
 
 
352 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03710  thiamine biosynthetic bifunctional enzyme, putative  36.79 
 
 
555 aa  124  8e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.036727  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1099  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.14 
 
 
210 aa  124  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.238552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.41 
 
 
218 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  4.7745e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.09 
 
 
208 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.62 
 
 
346 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
197 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.41 
 
 
211 aa  123  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 
215 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.89 
 
 
213 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.39 
 
 
222 aa  122  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34 
 
 
351 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.78 
 
 
207 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1159  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
212 aa  122  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.89 
 
 
220 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.45 
 
 
352 aa  121  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77822  predicted protein  35.98 
 
 
533 aa  121  6e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00729956  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2443  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.38 
 
 
206 aa  121  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0164937  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  39.04 
 
 
479 aa  121  9e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
351 aa  120  1e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0959  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  45.03 
 
 
214 aa  120  1e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.277889  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.68 
 
 
352 aa  120  1e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  7.36904e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  40.4 
 
 
492 aa  120  1e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.5 
 
 
479 aa  120  1e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>