More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0596 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  100 
 
 
451 aa  923    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  39.86 
 
 
462 aa  343  4e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  43.02 
 
 
450 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  40.5 
 
 
442 aa  329  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  38.35 
 
 
453 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1710  magnesium transporter  35.32 
 
 
459 aa  302  7.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  38.86 
 
 
461 aa  299  7e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  38.86 
 
 
461 aa  299  7e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  38.65 
 
 
452 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  40.85 
 
 
461 aa  294  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  36.57 
 
 
445 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  36.34 
 
 
445 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  36.49 
 
 
469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  36.2 
 
 
469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  35.68 
 
 
469 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  35.57 
 
 
468 aa  282  9e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  36.73 
 
 
450 aa  281  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  36.17 
 
 
482 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  35.51 
 
 
451 aa  280  4e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  35.43 
 
 
462 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  35.37 
 
 
468 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  37.16 
 
 
449 aa  277  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  35.43 
 
 
462 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  35.23 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  34.92 
 
 
468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  34.4 
 
 
466 aa  272  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  33.33 
 
 
458 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  32.8 
 
 
443 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  36.96 
 
 
453 aa  269  8.999999999999999e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  35.78 
 
 
449 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  35.85 
 
 
454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  32.73 
 
 
456 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  34.66 
 
 
471 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  34.27 
 
 
444 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  35.03 
 
 
463 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  33.86 
 
 
449 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  32.73 
 
 
452 aa  262  8.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  35.51 
 
 
450 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  34.62 
 
 
486 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  34.68 
 
 
465 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  34.98 
 
 
473 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5759  magnesium transporter  34.45 
 
 
450 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  37.83 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  35.59 
 
 
473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  34.4 
 
 
486 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  33.56 
 
 
473 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  34.83 
 
 
471 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  33.86 
 
 
449 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  32.08 
 
 
460 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  32.65 
 
 
444 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  31.82 
 
 
447 aa  251  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  33.49 
 
 
481 aa  250  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  32.35 
 
 
446 aa  250  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  31.89 
 
 
446 aa  250  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  33.1 
 
 
471 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  35.92 
 
 
473 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  32.27 
 
 
452 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  32.5 
 
 
454 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  33.94 
 
 
447 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  30.54 
 
 
453 aa  247  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  32.51 
 
 
470 aa  246  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  32.97 
 
 
463 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  33.97 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  34.21 
 
 
542 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  32.44 
 
 
479 aa  244  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  30.59 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  32.41 
 
 
463 aa  243  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  35.33 
 
 
473 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  30.97 
 
 
460 aa  242  7.999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  31.83 
 
 
452 aa  242  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  30.39 
 
 
480 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  29.61 
 
 
480 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  30.39 
 
 
480 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  34.62 
 
 
473 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  32.73 
 
 
485 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_002620  TC0466  magnesium transporter  30.91 
 
 
490 aa  241  2e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  29.93 
 
 
482 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  31.22 
 
 
454 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  29.93 
 
 
482 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  30.72 
 
 
471 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  34.12 
 
 
451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  30.16 
 
 
480 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  29.61 
 
 
480 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  30.07 
 
 
480 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  33.57 
 
 
471 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  34.04 
 
 
471 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  32.59 
 
 
460 aa  239  8e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  29.38 
 
 
480 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  31 
 
 
454 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  31.65 
 
 
460 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  33.57 
 
 
470 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  29.91 
 
 
480 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  33.41 
 
 
462 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  32.95 
 
 
454 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  32.29 
 
 
451 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  31 
 
 
454 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  31 
 
 
454 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  30.91 
 
 
454 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  33.64 
 
 
476 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  29.16 
 
 
480 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>