20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0594 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0868  hypothetical protein  37.24 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0799  hypothetical protein  37.26 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2674  hypothetical protein  37.26 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0763  hypothetical protein  34.08 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2452  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  92  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289718  normal  0.470045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  39.17 
 
 		 140 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  38.93 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2830  hypothetical protein  27.5 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1808  putative lipoprotein  25.78 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3028  hypothetical protein  38.66 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  29.87 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3871  lipoprotein, putative  24.67 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1854  hypothetical protein  51.06 
 
 		 61 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  24.11 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2386  hypothetical protein  30.56 
 
 		 125 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  24.34 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3029  hypothetical protein  60.53 
 
 		 64 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.522507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3787  lipoprotein, putative  24.89 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  41.6  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>