More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0550 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  66.31 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  64.71 
 
 		 187 aa  270  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  66.31 
 
 		 187 aa  268  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  65.78 
 
 		 187 aa  268  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  64.71 
 
 		 187 aa  266  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  62.57 
 
 		 187 aa  257  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  59.36 
 
 		 187 aa  244  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  41.71 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  41.71 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  42.78 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  40.43 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  41.18 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  40.64 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  38.5 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  40.64 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  39.57 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  38.5 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3237  elongation factor P-like protein YeiP  39.68 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2698  elongation factor P  37.04 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2777  elongation factor P  37.04 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  37.1 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  37.97 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  38.83 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  39.57 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  39.36 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2332  elongation factor P-like protein YeiP  38.1 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  36.9 
 
 		 187 aa  137  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  35.83 
 
 		 185 aa  138  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  40.64 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  40.64 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2429  elongation factor P  38.62 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1920  elongation factor P  37.57 
 
 		 190 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  38.59 
 
 		 190 aa  136  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1649  elongation factor P  37.57 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  37.1 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  36.56 
 
 		 187 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02101  elongation factor P  37.04 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.535663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2309  elongation factor P  37.04 
 
 		 275 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000534357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1486  elongation factor P-like protein YeiP  37.04 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000827349  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3309  elongation factor P  37.04 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000740697  normal  0.0270118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0790  elongation factor P  37.04 
 
 		 253 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1476  elongation factor P  37.04 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00371252  hitchhiker  0.0000156909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2320  elongation factor P  37.04 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00968365  hitchhiker  0.00148225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  36.51 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  36.51 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02060  hypothetical protein  37.04 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  36.51 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1806  elongation factor P  37.23 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  36.51 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2469  elongation factor P  37.04 
 
 		 275 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000100946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1082  translation elongation factor P  36.46 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.314487  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2766  elongation factor P  37.04 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  36.9 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  34.41 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  37.43 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1470  elongation factor P  37.77 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  34.41 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  37.63 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  36.36 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  36.9 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  36.7 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  37.23 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  36.02 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  36.56 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  33.7 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  38.5 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  35.29 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  36.9 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  35.83 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0845  elongation factor P  39.04 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  34.41 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  37.63 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  37.91 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  35.48 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  38.67 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  36.36 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  34.95 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  35.48 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  36.9 
 
 		 184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  35.48 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  34.95 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  32.8 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  34.41 
 
 		 185 aa  127  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  34.22 
 
 		 185 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  35.83 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  34.41 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  34.41 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  34.41 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0094  elongation factor P  36.9 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>