More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0465 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0465  ABC-type transport systems, ATPase components  100 
 
 
258 aa  524  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  51.78 
 
 
253 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
490 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.35 
 
 
536 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  38.49 
 
 
266 aa  185  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  38.49 
 
 
266 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  41.53 
 
 
260 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  38.71 
 
 
414 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  37.92 
 
 
418 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.45 
 
 
266 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.33 
 
 
409 aa  178  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  41.53 
 
 
269 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  38.21 
 
 
290 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.46 
 
 
258 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  38.46 
 
 
255 aa  175  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0562  ABC transporter related  35.06 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37.82 
 
 
405 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 
254 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  39 
 
 
286 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  35.44 
 
 
273 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
273 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  38.68 
 
 
278 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  38.06 
 
 
277 aa  168  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
273 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  38.89 
 
 
321 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  37.39 
 
 
424 aa  168  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
273 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 
256 aa  167  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
273 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  39 
 
 
259 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  34.89 
 
 
277 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.5 
 
 
271 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
273 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
273 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
273 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  38.89 
 
 
321 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  36.11 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.4 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  37.61 
 
 
274 aa  165  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  37.61 
 
 
419 aa  165  9e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  36.86 
 
 
260 aa  164  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  36.48 
 
 
275 aa  164  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  38.79 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  38.49 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  34.03 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  40.69 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  34.12 
 
 
264 aa  162  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  35.63 
 
 
268 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  37.13 
 
 
275 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  37.02 
 
 
265 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  38.56 
 
 
259 aa  161  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.71 
 
 
274 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.71 
 
 
274 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  35.32 
 
 
266 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  37.13 
 
 
275 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  38.72 
 
 
254 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  37.87 
 
 
293 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  36.1 
 
 
293 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  38.17 
 
 
252 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
262 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  35.46 
 
 
282 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.29 
 
 
268 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 
265 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  37.75 
 
 
261 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  37.75 
 
 
261 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  36.76 
 
 
297 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  36.99 
 
 
284 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.9 
 
 
285 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  36.76 
 
 
297 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  36.17 
 
 
265 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  36.76 
 
 
297 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  38.52 
 
 
275 aa  159  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  36.17 
 
 
265 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  37.75 
 
 
261 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  36.76 
 
 
297 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  35.39 
 
 
255 aa  159  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 
263 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 
295 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  36.36 
 
 
272 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  35.77 
 
 
254 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
278 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  35.95 
 
 
263 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  35.29 
 
 
307 aa  158  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.4 
 
 
265 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.4 
 
 
265 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.4 
 
 
265 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  36.48 
 
 
271 aa  158  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  37.75 
 
 
265 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  35.57 
 
 
308 aa  158  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  37.17 
 
 
274 aa  158  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.46 
 
 
257 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 
272 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 
263 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  36.13 
 
 
259 aa  157  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  36.65 
 
 
296 aa  157  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  34.07 
 
 
265 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>