More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0454 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  100 
 
 		 646 aa  1323    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  49.53 
 
 		 634 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  45.11 
 
 		 642 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  41.01 
 
 		 638 aa  458  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  35.62 
 
 		 671 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  34.58 
 
 		 673 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  34.7 
 
 		 692 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  35.09 
 
 		 613 aa  343  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  34.44 
 
 		 695 aa  335  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 690 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 659 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 634 aa  329  9e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 656 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 655 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  34.51 
 
 		 623 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 662 aa  306  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 618 aa  288  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 682 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 680 aa  282  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 714 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 670 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 671 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 625 aa  258  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 641 aa  257  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  28.96 
 
 		 638 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 634 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 627 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 616 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.03 
 
 		 1023 aa  227  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.17 
 
 		 631 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.19 
 
 		 623 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.85 
 
 		 616 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.18 
 
 		 631 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 638 aa  219  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.63 
 
 		 631 aa  219  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 645 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 614 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  28.53 
 
 		 628 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.13 
 
 		 615 aa  212  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.55 
 
 		 615 aa  209  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 698 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 614 aa  208  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.7 
 
 		 614 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.24 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.7 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 602 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.7 
 
 		 614 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.55 
 
 		 614 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 627 aa  204  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.96 
 
 		 614 aa  203  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.25 
 
 		 614 aa  204  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.83 
 
 		 631 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.81 
 
 		 614 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.99 
 
 		 630 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.99 
 
 		 630 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.81 
 
 		 614 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 737 aa  201  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.9 
 
 		 614 aa  201  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.81 
 
 		 614 aa  200  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 613 aa  197  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 628 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 613 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  28.99 
 
 		 611 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  28.87 
 
 		 618 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 635 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 620 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 626 aa  190  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.55 
 
 		 613 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 626 aa  189  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 597 aa  188  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.06 
 
 		 614 aa  186  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 647 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 624 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 632 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  28.18 
 
 		 617 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 624 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  28.53 
 
 		 666 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 619 aa  181  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 655 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 634 aa  180  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 624 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  28.27 
 
 		 666 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 641 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  28.65 
 
 		 663 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 617 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  28.27 
 
 		 666 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 627 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  28.9 
 
 		 666 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  28.9 
 
 		 666 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 640 aa  177  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  28.23 
 
 		 631 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  27.7 
 
 		 621 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  28.69 
 
 		 663 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  27.12 
 
 		 653 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.25 
 
 		 645 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.78 
 
 		 639 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28 
 
 		 630 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26.63 
 
 		 659 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  27.75 
 
 		 652 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  26.91 
 
 		 623 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>