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for query gene Pcar_0436 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  393  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
215 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  52.85 
 
 
196 aa  216  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  52.85 
 
 
196 aa  214  6e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  51.3 
 
 
193 aa  211  4e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  45.6 
 
 
198 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  45.99 
 
 
212 aa  172  2e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
212 aa  171  6e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  44.15 
 
 
212 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  44.15 
 
 
212 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
212 aa  164  1e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  46.28 
 
 
211 aa  162  2e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
213 aa  160  8e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
186 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  44.02 
 
 
186 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  42.78 
 
 
219 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 
214 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
212 aa  154  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
214 aa  154  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
210 aa  146  2e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  40.21 
 
 
209 aa  144  7e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
220 aa  141  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.82515e-09 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  38.54 
 
 
222 aa  140  1e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 
205 aa  140  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
209 aa  137  9e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
179 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
210 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 
227 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
202 aa  132  4e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  39.55 
 
 
219 aa  130  1e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 
192 aa  129  2e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
219 aa  128  5e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 
204 aa  127  9e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 
198 aa  127  1e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 
206 aa  125  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  40.97 
 
 
162 aa  120  1e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
207 aa  118  5e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
211 aa  117  8e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
191 aa  117  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
202 aa  117  1e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  33.14 
 
 
194 aa  101  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.02791e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 
205 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  32.77 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  33.69 
 
 
196 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
221 aa  98.2  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
194 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
222 aa  98.2  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
196 aa  97.8  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
199 aa  97.1  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  32.62 
 
 
196 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 
198 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
202 aa  94.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 
197 aa  94.4  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
176 aa  94.4  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
193 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  33.58 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  31.21 
 
 
195 aa  92.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
206 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  3.6044e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17006e-06 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
190 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
202 aa  91.7  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
206 aa  91.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
212 aa  91.7  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
212 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
200 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  33.7 
 
 
200 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
196 aa  87.8  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
199 aa  87  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
199 aa  87  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.15862e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
199 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
199 aa  87  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
199 aa  87  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
200 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
199 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.86036e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.39552e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
194 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
206 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  30.59 
 
 
196 aa  84.7  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
206 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
206 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
200 aa  83.2  2e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47212e-06 
 
 
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NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  34.56 
 
 
191 aa  83.6  2e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
213 aa  82.4  3e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  32.11 
 
 
194 aa  82.4  3e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
199 aa  82.4  3e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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