More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0414 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
171 aa  339  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 
172 aa  140  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
186 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 
177 aa  140  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
179 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 
184 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  43.29 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 
186 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
178 aa  131  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 
281 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
179 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
183 aa  127  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  41.36 
 
 
177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 
184 aa  124  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 
190 aa  124  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
184 aa  123  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 
179 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  37.58 
 
 
179 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  43.12 
 
 
183 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
199 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 
178 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 
176 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 
173 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 
173 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 
179 aa  122  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 
179 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 
179 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  38.18 
 
 
179 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  38.18 
 
 
179 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 
179 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  35.8 
 
 
185 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 
179 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
179 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  40.38 
 
 
171 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  35.93 
 
 
187 aa  121  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  37.58 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
180 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
180 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  40 
 
 
175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 
173 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
195 aa  117  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
180 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  38.85 
 
 
180 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  39.1 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
196 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
196 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  40 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
166 aa  111  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.8 
 
 
196 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
175 aa  111  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  37.65 
 
 
194 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
183 aa  110  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  44.51 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  35.76 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0604  MutT/nudix family protein  41.25 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 
194 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  39.88 
 
 
210 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.55 
 
 
196 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.55 
 
 
196 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  42.04 
 
 
169 aa  108  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  34.55 
 
 
196 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  34.55 
 
 
196 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.55 
 
 
196 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.55 
 
 
196 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
178 aa  107  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 
201 aa  107  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  37.18 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1537  MutT/nudix family protein  38.41 
 
 
184 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.652785  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
204 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.94 
 
 
196 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
186 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
182 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
187 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
204 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
187 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
169 aa  105  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
180 aa  105  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
211 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>