More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0375 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  201  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  67.31 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  63.46 
 
 		 104 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  63 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  62.14 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  59.62 
 
 		 104 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  63.73 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  61.54 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  61.54 
 
 		 104 aa  127  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  56.57 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  53.4 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  64.42 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  57 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  56.64 
 
 		 113 aa  120  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  55.77 
 
 		 104 aa  120  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  54.95 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  54.9 
 
 		 103 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  58.59 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  55.77 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  57.43 
 
 		 102 aa  117  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  56 
 
 		 100 aa  117  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  53.27 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  52.48 
 
 		 115 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  56.38 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  57.69 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  62.65 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  51 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  51 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  56.18 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  49 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  56.1 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  54.76 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  54.76 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  57.32 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  53 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  53.57 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  53.57 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  53.57 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  53.57 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  53.57 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  53.57 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  52 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  53.57 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  53.68 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  50.52 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  44.12 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  53.57 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  45.1 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  50 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  48.45 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  54.32 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  58.33 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  46.81 
 
 		 119 aa  94  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  51.65 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  47.47 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  42.72 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  42.72 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  42.16 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  44.86 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  49.38 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  42.27 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  49.38 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  51.06 
 
 		 118 aa  87  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  50.52 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  49.45 
 
 		 191 aa  86.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  49.48 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  49.48 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  43.27 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  42.39 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  40.62 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  39.58 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  39.58 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  49.45 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  48.45 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  40.59 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  43.48 
 
 		 100 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  42.72 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  46.15 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2803  hypothetical protein  48.45 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2672  hypothetical protein  48.45 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  42.57 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  45.16 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0875  hypothetical protein  46.39 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.477769  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  41.24 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0234  hypothetical protein  40.2 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  43.56 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  43.56 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  39.81 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>