More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0372 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  100 
 
 		 66 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2806  cold shock proteins  92.31 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.72104e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0778  cold shock proteins  87.88 
 
 		 66 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0658  cold-shock DNA-binding domain protein  83.08 
 
 		 66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.18008e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  83.08 
 
 		 66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.46 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  80 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.76 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  78.79 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  80 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000997397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  72.73 
 
 		 66 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0557  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.27 
 
 		 67 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  77.27 
 
 		 66 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  80.3 
 
 		 68 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2370  cold shock proteins  72.73 
 
 		 66 aa  105  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.71289e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  80.3 
 
 		 66 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3308  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 		 66 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0207  cold-shock domain-contain protein  74.24 
 
 		 66 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000092661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  78.79 
 
 		 68 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 		 66 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000279167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1391  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 		 66 aa  104  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000857842  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 		 66 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000494956  unclonable  0.00000584596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3009  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000338094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  81.54 
 
 		 66 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 		 67 aa  103  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  73.85 
 
 		 66 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0237  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.21 
 
 		 66 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692047  hitchhiker  0.0000000000000296416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.92 
 
 		 66 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2891  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 		 66 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.87323e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2005  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1727900000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2222  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 66 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  69.23 
 
 		 66 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1523  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.84 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.478782  normal  0.638647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 69 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  64.62 
 
 		 69 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 69 aa  98.6  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0958  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000177063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 69 aa  97.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.84 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 68 aa  97.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 65 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 68 aa  97.1  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 68 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 69 aa  97.1  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 		 69 aa  97.1  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2627  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 		 66 aa  96.7  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4220  cold-shock protein  66.67 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 69 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.13 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 		 69 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49410  cold-shock protein  66.67 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000191939  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0792  cold shock protein  67.74 
 
 		 69 aa  94.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000000912185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 65 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 69 aa  94.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 83 aa  94.4  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0979697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39180  Cold-shock-like protein  65.08 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 		 65 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 65 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  65.62 
 
 		 65 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  65.62 
 
 		 65 aa  94  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  65.62 
 
 		 65 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 68 aa  93.6  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  66.13 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  65.62 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 		 65 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.84 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 65 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>