More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0195 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  100 
 
 		 653 aa  1348    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 651 aa  263  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.05 
 
 		 675 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 665 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 674 aa  244  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 683 aa  240  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 678 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 657 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 685 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 654 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 668 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 656 aa  205  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 675 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  25.9 
 
 		 682 aa  196  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 731 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 731 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 669 aa  195  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 613 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 667 aa  190  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 693 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 718 aa  183  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 697 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  26.81 
 
 		 677 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 744 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 663 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 656 aa  163  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 708 aa  161  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 707 aa  159  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  26.54 
 
 		 633 aa  158  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  25.82 
 
 		 661 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 699 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 728 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 650 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.55 
 
 		 639 aa  151  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 716 aa  147  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 663 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 727 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 634 aa  147  9e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 649 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 642 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 690 aa  143  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  25.35 
 
 		 623 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 635 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 757 aa  140  7.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 653 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 656 aa  138  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  25.55 
 
 		 671 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 670 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.04 
 
 		 663 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.52 
 
 		 666 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.52 
 
 		 666 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 681 aa  133  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 634 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.36 
 
 		 666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.36 
 
 		 666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 709 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.79 
 
 		 666 aa  131  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  24.38 
 
 		 613 aa  131  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 698 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 698 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 698 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.16 
 
 		 663 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  25.54 
 
 		 638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 742 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 686 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 628 aa  122  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 661 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 828 aa  118  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 649 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.91 
 
 		 696 aa  117  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.91 
 
 		 696 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 836 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 714 aa  117  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 648 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 828 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.63 
 
 		 623 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 737 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 698 aa  114  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 705 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.11 
 
 		 646 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  23.19 
 
 		 636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  23.88 
 
 		 659 aa  112  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 618 aa  110  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 		 688 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 815 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 775 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 845 aa  108  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 647 aa  108  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 736 aa  107  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  25.69 
 
 		 641 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 626 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 625 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 679 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 662 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 675 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 626 aa  105  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 680 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 662 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>