More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0178 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 386 aa  738    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  34.95 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  30.11 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.2 
 
 		 389 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1676  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.45 
 
 		 391 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2056  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.29 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1852  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.18 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 		 614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 		 614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  29.94 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  27.74 
 
 		 609 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.49 
 
 		 609 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  26.11 
 
 		 614 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.67 
 
 		 609 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  27.67 
 
 		 609 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  27.67 
 
 		 609 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.67 
 
 		 609 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.67 
 
 		 609 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.67 
 
 		 609 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.67 
 
 		 609 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 		 611 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.47 
 
 		 609 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.58 
 
 		 388 aa  120  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  25.39 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 		 609 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0168  Sodium/hydrogen exchanger  26.08 
 
 		 387 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.38 
 
 		 608 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 		 609 aa  106  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  25.12 
 
 		 484 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.12 
 
 		 484 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1549  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.39 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  24.37 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 		 401 aa  89.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  25.34 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.36 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  27.74 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.35 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  25.77 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.53 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  22.34 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  24.75 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  23.58 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  24.61 
 
 		 666 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  25.99 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  25.98 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  28.11 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  22.89 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 		 751 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  23.62 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  24.55 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.65 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.02 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.65 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.65 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.65 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  28 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0897  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.38 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.38 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.1 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.93 
 
 		 604 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  22.82 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 		 692 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.38 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  23.84 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.38 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  25.76 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0334  sodium/hydrogen exchanger  24.57 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  23.29 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  29.32 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  23.29 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  23.29 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.29 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  24.44 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  23.84 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  23.29 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  23.29 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  23.82 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  20.81 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  26.91 
 
 		 727 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  24.19 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 		 749 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1980  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 603 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.846503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>