More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0108 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  100 
 
 		 198 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  50.79 
 
 		 190 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  50.79 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  52.15 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  52.53 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  48.09 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  50.57 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  47.73 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  50 
 
 		 260 aa  158  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  51.43 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  46.39 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  49.34 
 
 		 189 aa  147  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  44.04 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  43.52 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  43.52 
 
 		 195 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  45.31 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  45.31 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  39.8 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  45.31 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  46.75 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  47.46 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  44.56 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  46.99 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  43.98 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  45.22 
 
 		 201 aa  137  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  39.49 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  46.39 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  45.71 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  46.71 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  47.37 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  45.22 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  45 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  43.43 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  41.38 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  44.59 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  40.25 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  44.59 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  43.51 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  41.61 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  39.43 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  48.18 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  38.89 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  43.87 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  43.31 
 
 		 209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  44.44 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  45.39 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  45.45 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  42.54 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  42.5 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  42.13 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  42.7 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  40.49 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  40.49 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 206 aa  124  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  38.16 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  38.59 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  41.77 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  41.24 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  42.5 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  46.84 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  35.61 
 
 		 241 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  39.38 
 
 		 208 aa  121  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  39.77 
 
 		 210 aa  121  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  36.73 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  35.61 
 
 		 250 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  36.22 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  36.22 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  36.22 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  36.22 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  36.22 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  36.87 
 
 		 179 aa  120  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  45.52 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  37.93 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  36.46 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  36.08 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  40.91 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  36.08 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  37.56 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.22 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  44.37 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  42.86 
 
 		 174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  45.4 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  41.49 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  45.52 
 
 		 213 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  38.92 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>