More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0099 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5286  excinuclease ABC subunit B  63 
 
 
658 aa  823  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1385  excinuclease ABC subunit B  57.89 
 
 
674 aa  786  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4824  excinuclease ABC subunit B  61.02 
 
 
1011 aa  831  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.748709  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3444  excinuclease ABC subunit B  70.83 
 
 
665 aa  986  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00237393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0811  excinuclease ABC subunit B  58.27 
 
 
663 aa  795  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.31315e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4537  excinuclease ABC subunit B  60.42 
 
 
922 aa  819  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2037  Excinuclease ABC subunit B  62.05 
 
 
658 aa  833  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  6.74762e-06 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01374  excinuclease ABC subunit B  59.4 
 
 
673 aa  808  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0876  excinuclease ABC subunit B  60.7 
 
 
696 aa  812  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.31229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1396  excinuclease ABC subunit B  59.24 
 
 
697 aa  789  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0161452  normal  0.0208106 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2573  excinuclease ABC subunit B  61.23 
 
 
673 aa  810  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.76312e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1958  excinuclease ABC subunit B  59.15 
 
 
697 aa  795  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0291  excinuclease ABC, B subunit  61.33 
 
 
884 aa  833  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1833  excinuclease ABC subunit B  59.61 
 
 
669 aa  796  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3618  excinuclease ABC, B subunit  60.43 
 
 
677 aa  793  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29538  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2127  excinuclease ABC subunit B  58.54 
 
 
696 aa  785  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929321  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0467  excinuclease ABC subunit B  58.95 
 
 
718 aa  792  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00244529  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0862  excinuclease ABC subunit B  60.86 
 
 
673 aa  806  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00114313  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0925  excinuclease ABC subunit B  60.71 
 
 
673 aa  806  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00407979  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0948  excinuclease ABC subunit B  60.86 
 
 
673 aa  806  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00408059  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3671  excinuclease ABC, B subunit  60.84 
 
 
879 aa  824  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0704852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2271  excinuclease ABC subunit B  59.48 
 
 
668 aa  797  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.00123e-05  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2438  excinuclease ABC subunit B  60.09 
 
 
695 aa  800  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.615345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0884  excinuclease ABC, B subunit  60.27 
 
 
662 aa  805  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5329  excinuclease ABC subunit B  63 
 
 
658 aa  823  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2199  excinuclease ABC subunit B  60.78 
 
 
990 aa  826  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.166657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0325  excinuclease ABC subunit B  60.84 
 
 
743 aa  833  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.461917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0927  excinuclease ABC subunit B  61.23 
 
 
673 aa  810  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000192395  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1873  excinuclease ABC subunit B  60.54 
 
 
676 aa  824  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311007  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0971  excinuclease ABC, B subunit  60.64 
 
 
675 aa  820  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.91414  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0893  excinuclease ABC subunit B  60.86 
 
 
673 aa  806  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0045975  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0834  excinuclease ABC subunit B  60.86 
 
 
673 aa  806  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.53247e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0150  excinuclease ABC subunit B  70.85 
 
 
662 aa  969  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00713104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2586  excinuclease ABC subunit B  66.82 
 
 
699 aa  907  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02727  excinuclease ABC subunit B  63.14 
 
 
671 aa  843  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0835  excinuclease ABC subunit B  56.36 
 
 
661 aa  776  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1050  excinuclease ABC subunit B  59.24 
 
 
703 aa  793  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1894  excinuclease ABC subunit B  59.61 
 
 
669 aa  797  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4510  excinuclease ABC subunit B  60.91 
 
 
917 aa  827  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4967  excinuclease ABC subunit B  57.14 
 
 
698 aa  762  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3366  excinuclease ABC subunit B  56.68 
 
 
700 aa  772  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2192  excinuclease ABC subunit B  60.15 
 
 
725 aa  815  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2376  excinuclease ABC subunit B  62.16 
 
 
666 aa  830  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2050  excinuclease ABC subunit B  57.25 
 
 
731 aa  770  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.462256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2351  excinuclease ABC subunit B  60.67 
 
 
667 aa  813  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00949955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1317  excinuclease ABC subunit B  60.57 
 
 
670 aa  811  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.55227e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2046  excinuclease ABC subunit B  59.76 
 
 
675 aa  800  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0842  excinuclease ABC subunit B  61.23 
 
 
673 aa  810  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.96238e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0833  excinuclease ABC subunit B  61.23 
 
 
673 aa  810  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.01957e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02961  excinuclease ABC subunit B  61.77 
 
 
676 aa  824  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3530  excinuclease ABC subunit B  58.2 
 
 
670 aa  769  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.220409  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1544  excinuclease ABC subunit B  58.75 
 
 
672 aa  808  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2744  excinuclease ABC subunit B  62.03 
 
 
866 aa  835  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2288  excinuclease ABC subunit B  60.82 
 
 
771 aa  825  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.73396  normal  0.790773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2839  excinuclease ABC subunit B  60.45 
 
 
671 aa  799  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2159  excinuclease ABC subunit B  59.48 
 
 
668 aa  796  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000173586  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0259  excinuclease ABC subunit B  60.45 
 
 
662 aa  806  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000897839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4001  excinuclease ABC subunit B  58.05 
 
 
712 aa  791  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2234  excinuclease ABC subunit B  58.69 
 
 
696 aa  785  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2554  excinuclease ABC subunit B  59.37 
 
 
671 aa  805  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00351574  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0805  excinuclease ABC subunit B  60.27 
 
 
923 aa  818  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.733412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1539  excinuclease ABC subunit B  61.8 
 
 
671 aa  842  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.455329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0802  excinuclease ABC subunit B  61.23 
 
 
673 aa  810  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  5.0554e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2864  excinuclease ABC subunit B  61.23 
 
 
673 aa  810  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.93006e-06  normal  0.0188114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2926  excinuclease ABC subunit B  60.45 
 
 
671 aa  799  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.826263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0293  excinuclease ABC subunit B  62.76 
 
 
674 aa  855  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4253  excinuclease ABC subunit B  61.88 
 
 
761 aa  831  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.31724  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1505  excinuclease ABC subunit B  61.35 
 
 
671 aa  830  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1052  excinuclease ABC subunit B  62.41 
 
 
661 aa  852  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0552725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4959  excinuclease ABC subunit B  63.4 
 
 
658 aa  832  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4055  excinuclease ABC subunit B  60.57 
 
 
908 aa  816  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.660857  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1430  excinuclease ABC subunit B  60.3 
 
 
671 aa  795  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0631  excinuclease ABC subunit B  58.75 
 
 
672 aa  809  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1067  excinuclease ABC subunit B  59.15 
 
 
732 aa  788  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.641355  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2493  excinuclease ABC subunit B  67.12 
 
 
729 aa  918  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220361  decreased coverage  0.00080111 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3236  excinuclease ABC subunit B  55.99 
 
 
665 aa  760  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0013  excinuclease ABC, B subunit  63.57 
 
 
672 aa  850  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0350  excinuclease ABC, B subunit  58.26 
 
 
679 aa  780  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0204678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2956  excinuclease ABC subunit B  61.4 
 
 
670 aa  815  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3175  excinuclease ABC subunit B  63.21 
 
 
658 aa  834  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1825  excinuclease ABC, B subunit  59.73 
 
 
681 aa  808  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3030  excinuclease ABC subunit B  57.39 
 
 
739 aa  777  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00520932  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0799  excinuclease ABC subunit B  63.08 
 
 
665 aa  843  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.298665  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3957  excinuclease ABC subunit B  61.98 
 
 
674 aa  830  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.86158e-06  hitchhiker  1.63265e-08 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0410  excinuclease ABC, B subunit  64.49 
 
 
663 aa  846  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.662388  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2516  excinuclease ABC, B subunit  59.79 
 
 
716 aa  796  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0946  excinuclease ABC, B subunit  57.23 
 
 
746 aa  785  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1247  excinuclease ABC subunit B  58.26 
 
 
702 aa  773  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  4.94823e-06  normal  0.636224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2080  excinuclease ABC subunit B  62.97 
 
 
670 aa  860  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1407  excinuclease ABC, B subunit  62.06 
 
 
656 aa  811  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05320  Excinuclease ABC subunit B  59.33 
 
 
708 aa  789  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13020  excinuclease ABC subunit B  56.04 
 
 
705 aa  759  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2865  excinuclease ABC, B subunit  57.1 
 
 
718 aa  777  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002950  excinuclease ABC subunit B  62.44 
 
 
676 aa  827  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.33983e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0047  excinuclease ABC, B subunit  60.95 
 
 
687 aa  820  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06080  excinuclease ABC subunit B  56.86 
 
 
668 aa  764  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0965  excinuclease ABC, B subunit  57.96 
 
 
699 aa  781  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1485  excinuclease ABC subunit B  56.74 
 
 
702 aa  770  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2427  excinuclease ABC, B subunit  56.93 
 
 
720 aa  782  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1957  excinuclease ABC, B subunit  57.83 
 
 
701 aa  773  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.815633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>