243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0093 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0093  Sec-independent protein secretion pathway components  100 
 
 
89 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0975952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.18 
 
 
88 aa  76.3  1e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  4.47102e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  52.86 
 
 
111 aa  75.9  2e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.68 
 
 
140 aa  74.7  4e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  61.11 
 
 
103 aa  74.7  4e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.07779e-14  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
106 aa  71.2  4e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  65.96 
 
 
126 aa  70.5  7e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  61.7 
 
 
122 aa  68.9  2e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  52.46 
 
 
88 aa  67.4  6e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.20781e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  44.16 
 
 
122 aa  67.4  7e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.45044e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.45 
 
 
96 aa  65.9  2e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.32 
 
 
113 aa  63.5  8e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.32 
 
 
193 aa  63.2  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.57 
 
 
116 aa  60.8  5e-09  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  7.60884e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  54 
 
 
110 aa  60.5  7e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48 
 
 
155 aa  59.7  1e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  51.11 
 
 
60 aa  58.9  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.36 
 
 
92 aa  58.5  3e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60.98 
 
 
69 aa  56.6  1e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  44 
 
 
87 aa  56.6  1e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  58.14 
 
 
84 aa  56.2  1e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
91 aa  56.6  1e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 
61 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.08072e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 
61 aa  55.8  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.11362e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  54.17 
 
 
139 aa  55.8  2e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  45.9 
 
 
71 aa  56.2  2e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 
61 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.74823e-09  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  45.9 
 
 
71 aa  56.2  2e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  54.17 
 
 
146 aa  55.8  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  39.62 
 
 
91 aa  55.8  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 
61 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.48535e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 
61 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
55 aa  55.8  2e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 
61 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.80487e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  54.17 
 
 
139 aa  55.8  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 
61 aa  55.8  2e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.75615e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 
61 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.8794e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  39.62 
 
 
91 aa  55.8  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 
61 aa  55.8  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.77407e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 
104 aa  55.5  3e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  35.82 
 
 
95 aa  55.1  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 
88 aa  54.7  4e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  38.57 
 
 
83 aa  54.3  5e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 
96 aa  54.7  5e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 
88 aa  54.3  5e-07  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  56.1 
 
 
130 aa  54.3  6e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  31.43 
 
 
90 aa  54.3  6e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  46.3 
 
 
59 aa  53.9  7e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.87314e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.06 
 
 
140 aa  53.9  7e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  34.18 
 
 
92 aa  53.9  8e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  55.32 
 
 
56 aa  53.9  8e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.81 
 
 
207 aa  53.1  1e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.51 
 
 
214 aa  52.8  2e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.75 
 
 
152 aa  52  2e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.33 
 
 
115 aa  52.4  2e-06  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.33 
 
 
87 aa  52.4  2e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
90 aa  52.4  2e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  46.34 
 
 
162 aa  52  3e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  46.15 
 
 
56 aa  52  3e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.62 
 
 
96 aa  51.6  3e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  39.73 
 
 
76 aa  52  3e-06  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.62 
 
 
96 aa  51.6  3e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.44 
 
 
66 aa  51.2  4e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.72 
 
 
145 aa  51.2  4e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 
91 aa  50.8  5e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  34.78 
 
 
81 aa  51.2  5e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
77 aa  51.2  5e-06  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.35 
 
 
81 aa  51.2  5e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3518  twin arginine translocase protein A  48.81 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  5.24898e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  44.9 
 
 
147 aa  50.4  8e-06  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  46.94 
 
 
120 aa  50.4  8e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  42.22 
 
 
60 aa  50.1  9e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.62 
 
 
71 aa  50.1  1e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  40.82 
 
 
89 aa  49.7  1e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.48 
 
 
99 aa  50.1  1e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  47.73 
 
 
55 aa  49.7  1e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3587  twin arginine translocase protein A  58.49 
 
 
108 aa  48.9  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  34.29 
 
 
67 aa  49.3  2e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  6.23518e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  34.29 
 
 
155 aa  48.9  2e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.74 
 
 
96 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.86 
 
 
128 aa  48.5  3e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.85 
 
 
189 aa  48.5  3e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  48.84 
 
 
231 aa  48.5  3e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  44.44 
 
 
60 aa  48.5  3e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.6766e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  42.86 
 
 
229 aa  48.5  3e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  40 
 
 
57 aa  48.1  3e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.67 
 
 
64 aa  48.1  4e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  44.68 
 
 
71 aa  47.8  4e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  46.43 
 
 
162 aa  48.1  4e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.46 
 
 
169 aa  48.1  4e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.51 
 
 
55 aa  48.1  4e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  44.68 
 
 
71 aa  47.8  5e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2560  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.23 
 
 
68 aa  47.4  6e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.83587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.14 
 
 
90 aa  47.8  6e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  30.38 
 
 
104 aa  47.4  7e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.93 
 
 
234 aa  47.4  7e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  42.86 
 
 
149 aa  47  8e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.5 
 
 
79 aa  47  8e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  42.86 
 
 
101 aa  47  9e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1230  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.23 
 
 
70 aa  47  9e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.892691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>