219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0080 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 324 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  46.71 
 
 		 318 aa  292  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  50.32 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  48.93 
 
 		 323 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1402  methyltransferase  45.69 
 
 		 323 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  48.46 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  47.66 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  46.01 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  48.05 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  48.05 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2152  methyltransferase  47.3 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2430  hypothetical protein  47.3 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.116007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2169  methyltransferase  46.84 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  46.92 
 
 		 328 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  48.05 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2039  putative methyltransferase  46.98 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  48.38 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2670  methyltransferase  44.09 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  46.43 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  45.73 
 
 		 323 aa  279  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  48.05 
 
 		 318 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  44.48 
 
 		 332 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2094  methyltransferase  45.45 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2266  methyltransferase  47.32 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  50.19 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  47.25 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  47.34 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  47.73 
 
 		 318 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  45.94 
 
 		 332 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2787  putative methyltransferase  46.37 
 
 		 323 aa  275  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  45.17 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  45.17 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  45.17 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  51.91 
 
 		 330 aa  275  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  46.43 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  48.61 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  45.17 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  46.43 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  47.75 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  46.1 
 
 		 330 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  50 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  43.51 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2065  putative methyltransferase  51.26 
 
 		 323 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003929  tRNA (5-methoxyuridine) 34 synthase  43.55 
 
 		 323 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00210133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  51.26 
 
 		 323 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  51.26 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1341  putative methyltransferase  51.26 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  hitchhiker  0.00030781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  45.94 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  50.9 
 
 		 323 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.710945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  45.34 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2439  putative methyltransferase  46.6 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  45 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1810  methyltransferase  45.25 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01594  methyltransferase  43.23 
 
 		 323 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  43.04 
 
 		 321 aa  264  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1948  hypothetical protein  43.4 
 
 		 350 aa  259  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1884  putative methyltransferase  43.23 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0732  hypothetical protein  43.09 
 
 		 323 aa  258  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000183098  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0078  methyltransferase, putative  44.9 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0228138  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2548  methyltransferase, putative  47.45 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2241  methyltransferase, putative  40.79 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  45.49 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  44.6 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4909  methyltransferase, putative  38.85 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.628924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0291  putative methyltransferase  42.9 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2394  methyltransferase  40.24 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2062  hypothetical protein  37.89 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  38.81 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  40 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  43.83 
 
 		 285 aa  205  7e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  40.32 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  36.18 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.148018  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  36.64 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  36.64 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  36.64 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.12 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  25.28 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  29.32 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  25.82 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 253 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  28.74 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 225 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>