More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0076 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0076  transposase  100 
 
 
416 aa  849  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0574948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0577  putative transposase  100 
 
 
416 aa  849  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.5 
 
 
419 aa  221  1e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.5 
 
 
419 aa  221  1e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.5 
 
 
419 aa  222  1e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1615  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.5 
 
 
419 aa  221  1e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.5 
 
 
419 aa  221  1e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.862499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.47 
 
 
427 aa  221  2e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.47 
 
 
427 aa  221  2e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2146  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.77 
 
 
427 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2586  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.28 
 
 
427 aa  213  4e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1925  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.28 
 
 
427 aa  213  4e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0549  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.24 
 
 
384 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.82455e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0724  transposase  34.62 
 
 
425 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1750  transposase  34.86 
 
 
425 aa  210  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.905316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1293  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.67 
 
 
427 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2701  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.67 
 
 
427 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2674  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.67 
 
 
427 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1810  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.67 
 
 
427 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0650  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.67 
 
 
427 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1132  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.67 
 
 
427 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1019  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.67 
 
 
427 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.197197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0754  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.67 
 
 
427 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.353125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.67 
 
 
427 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.903868  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2829  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.93 
 
 
427 aa  201  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1826  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.93 
 
 
427 aa  201  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.508781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.93 
 
 
427 aa  201  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1351  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.93 
 
 
427 aa  201  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  7.96647e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0850  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.93 
 
 
427 aa  201  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.884754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.93 
 
 
427 aa  201  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.93 
 
 
427 aa  201  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.248005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2015  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.93 
 
 
427 aa  201  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.792556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1544  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.31 
 
 
424 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00314291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2089  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.37 
 
 
426 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.34168e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0073  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  189  6e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2076  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  189  6e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1121  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3002  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2182  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0220  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0728  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.10486e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0911  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  5.18715e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1023  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.43141e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2099  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1542  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  6.39136e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1551  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.73211e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.39746e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2083  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.70228e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2054  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
426 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1326  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.65 
 
 
426 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  7.22082e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0865  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.65 
 
 
426 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.03575e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2389  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.65 
 
 
426 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.33705e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.65 
 
 
426 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.86467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1699  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.65 
 
 
426 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.52786e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1369  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.65 
 
 
426 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.6519e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.65 
 
 
426 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.29716e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.18 
 
 
426 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.61 
 
 
393 aa  154  3e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.21 
 
 
406 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  28.7 
 
 
406 aa  146  7e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  28.7 
 
 
406 aa  146  7e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  31.92 
 
 
405 aa  144  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  3.06123e-09 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0266  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.9 
 
 
425 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0814  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.64 
 
 
433 aa  121  2e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00371841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0488  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.64 
 
 
433 aa  121  2e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.37882e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3315  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.64 
 
 
433 aa  121  2e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.579778  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.55 
 
 
402 aa  116  8e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1250  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.48 
 
 
428 aa  113  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0325438  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1409  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.17 
 
 
427 aa  112  1e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0745689 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0081  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.17 
 
 
427 aa  112  1e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.145375  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2297  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.17 
 
 
427 aa  112  1e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2199  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.17 
 
 
427 aa  112  1e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2151  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.17 
 
 
427 aa  112  1e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1318  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.17 
 
 
427 aa  112  1e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.141611  normal  0.0459431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  26.79 
 
 
429 aa  110  4e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  26.79 
 
 
429 aa  110  4e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  26.79 
 
 
429 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  26.79 
 
 
429 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0729  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.3 
 
 
427 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.876532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 
427 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3473  hypothetical protein  26.29 
 
 
403 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0880625 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3962  hypothetical protein  26.61 
 
 
403 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.462715  normal  0.0823882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1828  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.29 
 
 
403 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3558  hypothetical protein  26.29 
 
 
403 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3521  hypothetical protein  26.29 
 
 
403 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.57 
 
 
411 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5641  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.84 
 
 
425 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  23.57 
 
 
411 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  23.57 
 
 
411 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.92616e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4628  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.42 
 
 
420 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  24.5 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1909  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.82 
 
 
411 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1624  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.82 
 
 
411 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1454  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.82 
 
 
411 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>