More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0067 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
149 aa  292  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  51.39 
 
 
150 aa  154  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  50.68 
 
 
149 aa  144  4e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  44.97 
 
 
149 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  45.14 
 
 
153 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  44.97 
 
 
149 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  41.67 
 
 
153 aa  124  4e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  51.72 
 
 
149 aa  123  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  44.97 
 
 
150 aa  120  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
149 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
149 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
149 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
149 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
149 aa  119  1e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
149 aa  119  1e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  43.26 
 
 
291 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  42.55 
 
 
211 aa  115  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  41.78 
 
 
150 aa  112  2e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  40.16 
 
 
150 aa  99  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  40.94 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  38.78 
 
 
162 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.24 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  37.24 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  38.89 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  35.94 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  45.05 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  36.5 
 
 
140 aa  83.6  1e-15  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  38.03 
 
 
139 aa  82.8  1e-15  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 
149 aa  83.2  1e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  35.17 
 
 
144 aa  82  2e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  33.33 
 
 
154 aa  82.4  2e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
605 aa  81.3  4e-15  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  35.82 
 
 
141 aa  77.4  7e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  31.51 
 
 
154 aa  77  8e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  33.33 
 
 
188 aa  76.6  1e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  39.34 
 
 
142 aa  76.6  1e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  36.24 
 
 
185 aa  74.7  4e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.77 
 
 
478 aa  74.3  6e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  35.54 
 
 
130 aa  73.6  8e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  34.13 
 
 
139 aa  72.4  2e-12  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  38.17 
 
 
480 aa  72  2e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  34.11 
 
 
140 aa  71.2  5e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  34.65 
 
 
139 aa  69.7  1e-11  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  29.08 
 
 
165 aa  68.6  3e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 
250 aa  68.2  3e-11  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  33.87 
 
 
138 aa  68.2  4e-11  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 
141 aa  68.2  4e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  33.08 
 
 
141 aa  67.8  5e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  30.08 
 
 
139 aa  67.8  5e-11  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  26.9 
 
 
155 aa  67  7e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.9 
 
 
155 aa  67  7e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 
151 aa  67  8e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  32.33 
 
 
139 aa  66.6  1e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  35.83 
 
 
138 aa  65.9  2e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 
187 aa  65.5  3e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35 
 
 
138 aa  65.1  3e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  36.44 
 
 
601 aa  63.9  6e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  30.58 
 
 
165 aa  63.9  8e-10  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  33.61 
 
 
138 aa  63.2  1e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.15 
 
 
485 aa  63.2  1e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  30.25 
 
 
146 aa  63.2  1e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.43 
 
 
606 aa  62.8  1e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.43 
 
 
141 aa  63.5  1e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.65197e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  34.71 
 
 
139 aa  63.2  1e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
598 aa  62.8  2e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  35.48 
 
 
126 aa  61.2  4e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
143 aa  61.2  5e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  28.81 
 
 
145 aa  60.5  8e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3697  putative signal transduction protein with CBS domains  29.05 
 
 
146 aa  60.5  9e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  29.84 
 
 
139 aa  60.1  1e-08  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  33.33 
 
 
242 aa  59.7  1e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
145 aa  59.7  1e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  31.54 
 
 
155 aa  60.1  1e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  31.4 
 
 
589 aa  59.7  1e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  29.6 
 
 
189 aa  59.7  1e-08  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  34.11 
 
 
145 aa  59.7  1e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
262 aa  60.1  1e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.26291e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  31.67 
 
 
132 aa  59.3  2e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 
144 aa  59.3  2e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
143 aa  58.9  2e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  30.15 
 
 
170 aa  59.3  2e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  26.56 
 
 
188 aa  58.5  3e-08  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  29.01 
 
 
128 aa  58.5  3e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  31.25 
 
 
133 aa  58.5  3e-08  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
143 aa  58.5  3e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
143 aa  58.5  3e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  30.95 
 
 
141 aa  58.2  4e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.95 
 
 
141 aa  58.2  4e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  35.66 
 
 
145 aa  58.2  4e-08  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
146 aa  58.2  4e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  30.61 
 
 
411 aa  58.2  4e-08  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  30.56 
 
 
614 aa  58.2  4e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  33.07 
 
 
157 aa  58.2  4e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  28.1 
 
 
131 aa  58.2  4e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  3.12526e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  26.36 
 
 
140 aa  57.8  5e-08  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  32.23 
 
 
128 aa  57.8  5e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  39.17 
 
 
141 aa  57.8  5e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  30.65 
 
 
187 aa  57.8  5e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>