More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0066 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  100 
 
 
310 aa  630  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  36.84 
 
 
318 aa  184  2e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  36.9 
 
 
293 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  33.68 
 
 
272 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  35.25 
 
 
311 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  37.83 
 
 
320 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30.8 
 
 
263 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.90545e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  31.45 
 
 
256 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  34.63 
 
 
333 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  34.51 
 
 
320 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  34.32 
 
 
741 aa  145  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  34.51 
 
 
320 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.44 
 
 
275 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  33.22 
 
 
728 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  31.49 
 
 
263 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.49 
 
 
263 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.44848e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.49 
 
 
263 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  31.13 
 
 
751 aa  142  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  6.72418e-09 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.77 
 
 
275 aa  142  9e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  31.83 
 
 
263 aa  141  1e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  32.03 
 
 
324 aa  140  2e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  31.14 
 
 
263 aa  141  2e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  31.14 
 
 
263 aa  141  2e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  31.14 
 
 
263 aa  141  2e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  30.8 
 
 
263 aa  140  2e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  35.39 
 
 
767 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.44 
 
 
275 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  31.14 
 
 
263 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  32.36 
 
 
727 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  2.93733e-06 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.49 
 
 
263 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.04019e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.88 
 
 
302 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  32.04 
 
 
728 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.67 
 
 
751 aa  137  3e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.58 
 
 
728 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  32.99 
 
 
308 aa  135  6e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  33.09 
 
 
253 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.06968e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  31.72 
 
 
317 aa  134  1e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  7.66649e-06  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  29.84 
 
 
733 aa  134  2e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  33.44 
 
 
852 aa  134  2e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  31.72 
 
 
315 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.63376e-05  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  33.56 
 
 
273 aa  133  4e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  33.12 
 
 
796 aa  133  4e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  32.16 
 
 
347 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  2.14716e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  32.91 
 
 
728 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  32.04 
 
 
305 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  32.04 
 
 
305 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.44738e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  32.04 
 
 
306 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  32.54 
 
 
349 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  2.27608e-05  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  32.08 
 
 
737 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  32.91 
 
 
930 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  32.91 
 
 
945 aa  132  7e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  32.91 
 
 
920 aa  132  7e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  32.91 
 
 
933 aa  132  7e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  32.16 
 
 
474 aa  132  7e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  4.6656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  32.8 
 
 
803 aa  132  7e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  29.22 
 
 
740 aa  132  8e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  32.48 
 
 
804 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  32.98 
 
 
302 aa  132  1e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  32.16 
 
 
347 aa  131  1e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  32.16 
 
 
347 aa  131  1e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  32.55 
 
 
735 aa  131  1e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.55516e-06  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  32.75 
 
 
306 aa  131  1e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  1.89293e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  31.45 
 
 
734 aa  131  2e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  33.55 
 
 
813 aa  131  2e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  32.48 
 
 
803 aa  130  2e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  32.48 
 
 
803 aa  130  2e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  2.95709e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  30.53 
 
 
738 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  30.99 
 
 
287 aa  130  4e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  32.8 
 
 
798 aa  130  4e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95852e-07 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  34.43 
 
 
327 aa  130  4e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  32.63 
 
 
302 aa  129  5e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  34.69 
 
 
298 aa  129  7e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.14 
 
 
760 aa  129  9e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  37.85 
 
 
323 aa  129  9e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  36.97 
 
 
323 aa  128  1e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  30.54 
 
 
735 aa  128  1e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  30.64 
 
 
737 aa  128  1e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  30.69 
 
 
260 aa  128  1e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  35.44 
 
 
346 aa  128  2e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  32.64 
 
 
777 aa  127  2e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  32.89 
 
 
667 aa  127  2e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  32.7 
 
 
981 aa  127  2e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  30.69 
 
 
750 aa  127  2e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  32.9 
 
 
728 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.23 
 
 
301 aa  126  4e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.79 
 
 
330 aa  126  4e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  1.89708e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  29.91 
 
 
738 aa  126  4e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  32.14 
 
 
753 aa  126  4e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  29.91 
 
 
738 aa  126  4e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.67 
 
 
311 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  30.19 
 
 
739 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  29.39 
 
 
740 aa  126  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.82 
 
 
733 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.59 
 
 
358 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  32.59 
 
 
754 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  32.4 
 
 
358 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  29.12 
 
 
259 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  30.74 
 
 
318 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  29.72 
 
 
748 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  32.79 
 
 
714 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>