More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0062 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  100 
 
 
720 aa  1411  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  49.35 
 
 
558 aa  461  1e-128  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  48.79 
 
 
548 aa  455  1e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  50.56 
 
 
547 aa  447  1e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  50.56 
 
 
547 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  46.34 
 
 
595 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  46.08 
 
 
562 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  49.91 
 
 
575 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  47.84 
 
 
572 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  47.07 
 
 
551 aa  422  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  48.97 
 
 
546 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  47.23 
 
 
561 aa  417  1e-115  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  45.39 
 
 
566 aa  406  1e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  44.67 
 
 
541 aa  405  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  45.59 
 
 
572 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  47.3 
 
 
566 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  45.32 
 
 
561 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  52.79 
 
 
424 aa  344  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  33.97 
 
 
566 aa  325  3e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  34.57 
 
 
565 aa  322  2e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 
566 aa  319  1e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  1.10445e-08 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 
566 aa  302  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  28.91 
 
 
674 aa  247  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 
571 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 
577 aa  221  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.63 
 
 
575 aa  217  6e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.25 
 
 
697 aa  217  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 
592 aa  214  5e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  31.62 
 
 
576 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  27.14 
 
 
682 aa  208  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 
636 aa  208  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 
775 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.91 
 
 
671 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 
574 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  28.44 
 
 
648 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  28.13 
 
 
648 aa  203  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 
574 aa  202  2e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  28.46 
 
 
648 aa  202  2e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 
741 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 
664 aa  199  2e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 
578 aa  197  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  26.99 
 
 
650 aa  196  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  28.46 
 
 
648 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 
762 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 
672 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.59 
 
 
648 aa  192  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  27.34 
 
 
648 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  26.71 
 
 
658 aa  191  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  30.26 
 
 
581 aa  191  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  27.67 
 
 
666 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.14201e-07 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.6 
 
 
670 aa  189  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.5266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  26.88 
 
 
648 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  26.88 
 
 
648 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  26.65 
 
 
648 aa  186  1e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 
666 aa  185  2e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  24.22 
 
 
662 aa  185  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  27.2 
 
 
649 aa  184  4e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  27.07 
 
 
649 aa  184  5e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 
598 aa  184  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 
649 aa  184  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  27.5 
 
 
649 aa  181  3e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  28.63 
 
 
662 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  27.18 
 
 
584 aa  179  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  26.66 
 
 
773 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 
668 aa  179  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  26.11 
 
 
650 aa  178  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
652 aa  177  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.95 
 
 
567 aa  177  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 
673 aa  176  1e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 
665 aa  176  1e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  26.72 
 
 
671 aa  176  1e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 
665 aa  176  1e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 
666 aa  175  3e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 
567 aa  175  3e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  25.99 
 
 
653 aa  175  3e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 
585 aa  175  3e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  27.58 
 
 
674 aa  174  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.66 
 
 
655 aa  173  8e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
660 aa  173  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  26.73 
 
 
664 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 
656 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 
624 aa  171  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 
567 aa  171  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 
659 aa  170  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  23.7 
 
 
665 aa  168  3e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  26.54 
 
 
658 aa  168  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 
693 aa  168  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  27.91 
 
 
660 aa  167  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  26.39 
 
 
665 aa  167  6e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 
659 aa  166  2e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.7 
 
 
680 aa  166  2e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 
676 aa  166  2e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 
654 aa  166  2e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.55 
 
 
663 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 
577 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.38 
 
 
720 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  26.13 
 
 
584 aa  160  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  25.23 
 
 
771 aa  160  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 
584 aa  159  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 
586 aa  159  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>