149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0057 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  75.32 
 
 		 640 aa  998    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  51.96 
 
 		 624 aa  676    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 		 645 aa  1317    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  54.08 
 
 		 623 aa  674    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.9 
 
 		 621 aa  662    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.58 
 
 		 629 aa  642    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  73.82 
 
 		 641 aa  984    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  50.32 
 
 		 626 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  52.35 
 
 		 629 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  50.32 
 
 		 625 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.73 
 
 		 628 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.96 
 
 		 629 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.91 
 
 		 631 aa  594  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.45 
 
 		 635 aa  591  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.61 
 
 		 663 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  50.24 
 
 		 629 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48 
 
 		 627 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.11 
 
 		 653 aa  586  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.83 
 
 		 639 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.6 
 
 		 635 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.36 
 
 		 635 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.54 
 
 		 679 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.99 
 
 		 642 aa  526  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.38 
 
 		 632 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.93 
 
 		 656 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.31 
 
 		 672 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.46 
 
 		 663 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.03 
 
 		 674 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.86 
 
 		 628 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.22 
 
 		 673 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.05 
 
 		 674 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.51 
 
 		 666 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.06 
 
 		 669 aa  415  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.44 
 
 		 655 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.25 
 
 		 670 aa  399  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.42 
 
 		 663 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.31 
 
 		 676 aa  367  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.15 
 
 		 637 aa  361  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.1 
 
 		 695 aa  353  5e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.49 
 
 		 679 aa  352  8.999999999999999e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.17 
 
 		 623 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.91 
 
 		 634 aa  343  4e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.07 
 
 		 629 aa  340  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.3 
 
 		 648 aa  332  1e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.8 
 
 		 707 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.3 
 
 		 710 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  29.86 
 
 		 680 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  24.32 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  24.11 
 
 		 547 aa  73.9  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  25.99 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  25.89 
 
 		 538 aa  68.9  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  27.91 
 
 		 549 aa  63.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  23.58 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1595  hydroxylamine reductase  28.99 
 
 		 543 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.333402  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  26 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0749  hydroxylamine reductase  24.4 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000113817  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0479  hydroxylamine reductase  24.57 
 
 		 540 aa  60.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  28.5 
 
 		 547 aa  60.1  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  26.7 
 
 		 545 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  25.53 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  25.52 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  23.95 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  26.06 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  26.51 
 
 		 568 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  25.17 
 
 		 554 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2875  hydroxylamine reductase  23.08 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1919  hydroxylamine reductase  27.13 
 
 		 553 aa  55.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.877615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  28.42 
 
 		 538 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2242  hydroxylamine reductase  24.65 
 
 		 541 aa  54.3  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.675401  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  23.23 
 
 		 539 aa  54.3  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  23.91 
 
 		 544 aa  53.9  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  24.33 
 
 		 562 aa  53.9  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  23.7 
 
 		 552 aa  53.9  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  23.55 
 
 		 554 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  23.17 
 
 		 554 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  24.87 
 
 		 551 aa  52.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  24.56 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  23.91 
 
 		 532 aa  52.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  20.92 
 
 		 787 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  24.88 
 
 		 555 aa  52.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  24.5 
 
 		 554 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  23.37 
 
 		 540 aa  52  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  24.64 
 
 		 554 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0970  hydroxylamine reductase  21.32 
 
 		 591 aa  50.8  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  23.86 
 
 		 554 aa  50.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  25.81 
 
 		 552 aa  50.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1490  hydroxylamine reductase  23.75 
 
 		 540 aa  50.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000660036  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  25.62 
 
 		 621 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0105  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  21.02 
 
 		 766 aa  50.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  26.04 
 
 		 522 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  23.28 
 
 		 535 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  23.27 
 
 		 550 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  25.73 
 
 		 427 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  23.21 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  23.72 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  23.36 
 
 		 525 aa  49.7  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  23.21 
 
 		 554 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0512  hydroxylamine reductase  25.91 
 
 		 540 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.96139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  24.73 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  23.14 
 
 		 550 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>