12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0055 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0055  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  416  1e-115  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2966  hypothetical protein  60.22 
 
 
184 aa  231  8e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.927571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1349  hypothetical protein  58.06 
 
 
184 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0805  hypothetical protein  59.46 
 
 
184 aa  222  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0431  hypothetical protein  56.76 
 
 
184 aa  218  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.600606  normal  0.255698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1632  hypothetical protein  56.52 
 
 
182 aa  216  3e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.118515  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2019  hypothetical protein  58.33 
 
 
184 aa  209  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000794763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0549  hypothetical protein  46.97 
 
 
431 aa  183  1e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2291  hypothetical protein  48.63 
 
 
434 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1661  hypothetical protein  46.45 
 
 
431 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1584  hypothetical protein  46.81 
 
 
431 aa  164  1e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2814  hypothetical protein  42.13 
 
 
430 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.512389  normal  0.971887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>