More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0051 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 
281 aa  570  1e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  65.59 
 
 
276 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.43 
 
 
280 aa  332  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.86 
 
 
284 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.52 
 
 
284 aa  332  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.57708e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.59 
 
 
286 aa  328  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.50727e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.07 
 
 
281 aa  326  2e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.87 
 
 
283 aa  325  4e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.65 
 
 
277 aa  318  7e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  59.86 
 
 
285 aa  311  7e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.68 
 
 
290 aa  308  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.09 
 
 
288 aa  307  1e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.73 
 
 
286 aa  304  9e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.44062e-15  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.79 
 
 
281 aa  303  3e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.74 
 
 
278 aa  302  5e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  54.48 
 
 
291 aa  299  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.48 
 
 
291 aa  299  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  3.42519e-05 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.06 
 
 
284 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 
300 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.17 
 
 
296 aa  286  3e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.76 
 
 
294 aa  283  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.76 
 
 
294 aa  283  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.52 
 
 
309 aa  283  3e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.21 
 
 
306 aa  281  8e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.38 
 
 
293 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.08 
 
 
309 aa  279  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  50.5 
 
 
312 aa  278  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.38 
 
 
298 aa  273  2e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.72 
 
 
277 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.45 
 
 
291 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  2.25432e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.11 
 
 
329 aa  252  5e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.71 
 
 
344 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  35.63 
 
 
338 aa  183  2e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  36.14 
 
 
331 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  34.73 
 
 
323 aa  169  6e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  35.35 
 
 
323 aa  169  7e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  35.35 
 
 
323 aa  169  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  35.35 
 
 
323 aa  168  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  35.65 
 
 
330 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.81 
 
 
329 aa  164  2e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  34.38 
 
 
330 aa  164  2e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  35.31 
 
 
330 aa  163  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  33.97 
 
 
324 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  45.03 
 
 
203 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.78 
 
 
328 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  33.13 
 
 
333 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  33.33 
 
 
333 aa  156  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.63 
 
 
203 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.21 
 
 
203 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.88 
 
 
203 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  43.09 
 
 
203 aa  148  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.32 
 
 
145 aa  147  1e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.89 
 
 
200 aa  147  2e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  58.47 
 
 
125 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.78 
 
 
137 aa  145  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.74 
 
 
203 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  57.63 
 
 
144 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.08 
 
 
131 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  57.14 
 
 
124 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  57.63 
 
 
142 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  39.27 
 
 
203 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  55.93 
 
 
149 aa  141  1e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  57.63 
 
 
129 aa  141  1e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52 
 
 
150 aa  141  1e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.85 
 
 
127 aa  140  2e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.27457e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.28 
 
 
154 aa  140  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  55.08 
 
 
144 aa  139  4e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.71 
 
 
153 aa  138  9e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  55.93 
 
 
143 aa  137  3e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  57.02 
 
 
128 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  52.99 
 
 
123 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.34 
 
 
137 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  53.23 
 
 
173 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  8.03052e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  57.02 
 
 
128 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  57.02 
 
 
128 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  57.02 
 
 
128 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  57.02 
 
 
128 aa  135  1e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  57.02 
 
 
128 aa  135  1e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  1.35167e-09 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  57.02 
 
 
128 aa  135  1e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.39 
 
 
124 aa  134  1e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  4.51937e-06 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  55.56 
 
 
143 aa  134  1e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  50.43 
 
 
129 aa  134  2e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.57 
 
 
146 aa  134  2e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.74717e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  56.2 
 
 
128 aa  134  2e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.61 
 
 
207 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  56.2 
 
 
128 aa  133  4e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  50.38 
 
 
139 aa  132  4e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  48.84 
 
 
133 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.72 
 
 
133 aa  132  8e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 
134 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  54.55 
 
 
128 aa  131  1e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  54.55 
 
 
128 aa  131  1e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  51.69 
 
 
122 aa  130  2e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.19001e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.85 
 
 
138 aa  130  2e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.53527e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  51.64 
 
 
150 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  52.54 
 
 
139 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.96101e-12  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1443  scaffold protein  50 
 
 
148 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0899521  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 
135 aa  129  4e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.07 
 
 
128 aa  127  1e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  49.61 
 
 
133 aa  128  1e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>