More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0048 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0048  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), K-small subunit  100 
 
 
468 aa  973    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.923386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1606  putative Fe-S oxidoreductase  72.41 
 
 
470 aa  717    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.822852  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1125  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.79 
 
 
499 aa  176  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3301  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.8 
 
 
415 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4113  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.97 
 
 
416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2960  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  26.35 
 
 
448 aa  160  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0069  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.32 
 
 
409 aa  156  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2842  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.32 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000733482  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2518  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.05 
 
 
461 aa  153  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0931  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  26.05 
 
 
478 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.81 
 
 
459 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0813  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.77 
 
 
455 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0817  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.55 
 
 
455 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0766  hypothetical protein  26.68 
 
 
455 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4561  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.87 
 
 
453 aa  143  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0812  hypothetical protein  26.38 
 
 
454 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0290283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4146  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.34 
 
 
403 aa  133  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2807  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.57 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.632443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0419  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.86 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02169  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), small subunit  26.33 
 
 
396 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3955  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.16 
 
 
403 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02128  hypothetical protein  26.33 
 
 
396 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2384  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.33 
 
 
396 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2625  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.33 
 
 
396 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1416  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  26.33 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3380  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.33 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1408  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.33 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2541  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.08 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.08 
 
 
400 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3989  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.71 
 
 
415 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.379671  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0539  hypothetical protein  26.17 
 
 
445 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0567  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.71 
 
 
431 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.19 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2490  hypothetical protein  26.44 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.08 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0229  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.46 
 
 
415 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2628  hypothetical protein  26.23 
 
 
445 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0250  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.69 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0836  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.57 
 
 
447 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000205692  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2630  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.32 
 
 
396 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.484622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1019  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.27 
 
 
400 aa  126  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.32 
 
 
396 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444575  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2526  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.32 
 
 
396 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2422  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.32 
 
 
396 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2471  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.57 
 
 
396 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.496093  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0576  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.61 
 
 
426 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000399762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2097  putative ferredoxin  24.49 
 
 
449 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1846  putative ferredoxin  26.38 
 
 
443 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000698817  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0269  hypothetical protein  26.44 
 
 
445 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0922  putative ferredoxin  26.28 
 
 
445 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1646  hypothetical protein  26.44 
 
 
445 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0301  hypothetical protein  26.44 
 
 
445 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.4 
 
 
426 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0688  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.5 
 
 
413 aa  123  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.01 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0158986 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1449  hypothetical protein  26.23 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1107  putative ferredoxin  24.3 
 
 
442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0158261  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4115  Fe-S oxidoreductase-like protein  24.26 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  23.56 
 
 
423 aa  121  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2673  putative ferredoxin  24.74 
 
 
454 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3719  Fe-S oxidoreductase-like protein  25 
 
 
445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.320551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5542  Fe-S oxidoreductase-like protein  25.48 
 
 
445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  24.08 
 
 
1020 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  27.46 
 
 
423 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3715  putative ferredoxin  22.29 
 
 
449 aa  113  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0539693  normal  0.153427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.37 
 
 
428 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3708  Fe-S oxidoreductase-like protein  24.57 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4547  Fe-S oxidoreductase-like  24.57 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.975746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3816  Fe-S oxidoreductase-like protein  24.57 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  26.16 
 
 
421 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3639  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  22.51 
 
 
456 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  26.99 
 
 
421 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  24.79 
 
 
421 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  25.12 
 
 
423 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2374  putative ferredoxin  23.09 
 
 
466 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.790506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  24.74 
 
 
428 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2280  Fe-S oxidoreductase-like  24.09 
 
 
445 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.9 
 
 
423 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1519  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  24.38 
 
 
409 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.717289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.01 
 
 
434 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1037  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.32 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.106795  normal  0.550231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.98 
 
 
722 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  22.32 
 
 
1055 aa  96.7  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  22.63 
 
 
1070 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.55 
 
 
976 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  23.2 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  24.65 
 
 
984 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  21.66 
 
 
431 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  21.71 
 
 
446 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  24.02 
 
 
730 aa  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1222  hypothetical protein  24.25 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332946  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.92 
 
 
395 aa  89  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1132  conserved hypothetical protein, putative iron-sulfur-cluster binding protein  23.71 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  23.08 
 
 
1023 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1047  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.17 
 
 
429 aa  87.8  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.74 
 
 
1007 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.21 
 
 
978 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.34 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  25.37 
 
 
717 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  24.7 
 
 
714 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>