More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0044 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  100 
 
 
352 aa  714    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  61.09 
 
 
321 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  60.59 
 
 
319 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  52.38 
 
 
345 aa  316  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  48.4 
 
 
328 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  49.52 
 
 
333 aa  300  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  49.52 
 
 
385 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  49.07 
 
 
340 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  46.89 
 
 
333 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  48.39 
 
 
327 aa  288  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  48.01 
 
 
354 aa  266  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  45.16 
 
 
357 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  46.01 
 
 
349 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 
357 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  43.61 
 
 
346 aa  258  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  37.06 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  36.74 
 
 
253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
232 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
340 aa  106  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
243 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.97 
 
 
355 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 
228 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
340 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
395 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
228 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
228 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
271 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  29.61 
 
 
749 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  35.08 
 
 
260 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
230 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
301 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
230 aa  99.4  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.63 
 
 
220 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
227 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
226 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
237 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
230 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
245 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
340 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
295 aa  96.7  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
245 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
220 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
250 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  25.97 
 
 
313 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
220 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  30.18 
 
 
883 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
284 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
229 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
243 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
222 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
226 aa  92.4  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  27.01 
 
 
531 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
245 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
246 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.38 
 
 
260 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
448 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
229 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.73 
 
 
809 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
242 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
242 aa  89.7  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
347 aa  89.4  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
242 aa  89.4  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.29 
 
 
239 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  31.31 
 
 
245 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  28.69 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
230 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
246 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
242 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0992  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
240 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.861872  hitchhiker  0.00252858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
246 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.5 
 
 
528 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.07 
 
 
244 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.41 
 
 
310 aa  87  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
287 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.52 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.47 
 
 
248 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.55 
 
 
305 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
304 aa  86.3  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.07 
 
 
246 aa  86.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  26.94 
 
 
247 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.47 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  29.09 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>